94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2768 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  69.64 
 
 		 127 aa  173  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  64.71 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  50.93 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  56.48 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  55.06 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  53.57 
 
 		 130 aa  105  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  60.71 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  60.71 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  47 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  45.54 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  45.54 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  45.54 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  45.54 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  45.54 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  45.54 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  50.54 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  45.54 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  44.55 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  44.55 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  44.55 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  44.55 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  44.55 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  44.55 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  45 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  48.24 
 
 		 125 aa  95.9  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  45.26 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  47.06 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  42.42 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  46.6 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  44.9 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  42.42 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  44.09 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  43.18 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  46.34 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  34.72 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  33.33 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  30.14 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  28.99 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  31.45 
 
 		 203 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  26.76 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  30.14 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  30.14 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  30.14 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  30.14 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  25 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  28.38 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  30.43 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  30.43 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  28.57 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  30.43 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  35.29 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  26.53 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  26.76 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  27 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  33.33 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  33.33 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  30.77 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  29.49 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  32.84 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  31.33 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  28.38 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  28.38 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  28.38 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  27.27 
 
 		 169 aa  43.5  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  33.33 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  25.49 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  30 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  23.08 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  22.34 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  40.38 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  25.32 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  27.06 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  31.37 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  30.25 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  26.25 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  35.29 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  38.46 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  25.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  32 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  36.99 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  28.77 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  29.09 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  36.54 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  24.29 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  26.09 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  31.37 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  25.3 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  25.68 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  33.71 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  32.93 
 
 		 137 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  26.92 
 
 		 120 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0760  ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2-like protein  25 
 
 		 120 aa  40  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.511664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  36.54 
 
 		 144 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>