More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2724 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  100 
 
 		 322 aa  666    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  76.78 
 
 		 323 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  75.16 
 
 		 321 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  72.56 
 
 		 322 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  62.26 
 
 		 321 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  64.35 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  60.69 
 
 		 321 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  61.64 
 
 		 321 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  61.64 
 
 		 321 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  59.43 
 
 		 321 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  61.61 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  60.5 
 
 		 321 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  59.25 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  59.81 
 
 		 316 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  60.13 
 
 		 316 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  59.49 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  57.59 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  59.18 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  57.28 
 
 		 316 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  58.23 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  58.81 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  57.59 
 
 		 315 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  53.16 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  55.03 
 
 		 319 aa  345  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  52.19 
 
 		 320 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  52.53 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  51.86 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  51.53 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  50.95 
 
 		 317 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  50 
 
 		 319 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  50.63 
 
 		 317 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  53.48 
 
 		 319 aa  322  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  53.5 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  48.55 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  46.86 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  46.86 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  49.51 
 
 		 326 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  49.53 
 
 		 334 aa  301  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  45.62 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  46.03 
 
 		 318 aa  295  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  47.47 
 
 		 324 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  46.23 
 
 		 588 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  45.03 
 
 		 319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.31 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  44.24 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  45.74 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  41.82 
 
 		 337 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  40.99 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.96 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  44.48 
 
 		 784 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  43.61 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  43.83 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  45.78 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  42.72 
 
 		 788 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  43.79 
 
 		 316 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  43.79 
 
 		 316 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  43.38 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  44.48 
 
 		 322 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  42.27 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  42.77 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  42.94 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  39.12 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  43.22 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  40.88 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  42.32 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  43.4 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  42.77 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  42.86 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  43.21 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  39.69 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  39.69 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  42.77 
 
 		 352 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  40.85 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  41.54 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  42.86 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  40.75 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  41.98 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  43.28 
 
 		 784 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  43.28 
 
 		 784 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  43.28 
 
 		 784 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  43.28 
 
 		 784 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  41.67 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  40.18 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  40.18 
 
 		 321 aa  236  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  40.18 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  39.88 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  43.28 
 
 		 784 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  42.95 
 
 		 783 aa  235  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  41.74 
 
 		 323 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.18 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  42.95 
 
 		 784 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  42.95 
 
 		 784 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.18 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.49 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  42.46 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  42.01 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  39.88 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  41.25 
 
 		 782 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  39.57 
 
 		 321 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  40.85 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>