More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2692 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 		 408 aa  832    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  63.11 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  63.12 
 
 		 410 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.32 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  63.28 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  63.37 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  60.79 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  61.54 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  60.79 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  61.79 
 
 		 402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.93 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  59.8 
 
 		 406 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  59.7 
 
 		 403 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.28 
 
 		 406 aa  461  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  58.68 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  57.67 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  63.9 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  49.33 
 
 		 446 aa  358  9e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  48.01 
 
 		 414 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  50.54 
 
 		 407 aa  345  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.79 
 
 		 416 aa  335  7e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  47.7 
 
 		 412 aa  322  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  41.75 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  46.22 
 
 		 426 aa  306  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  43.77 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  31.01 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  37.24 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  33.8 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.84 
 
 		 416 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  32.21 
 
 		 369 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  34.2 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  32.87 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.05 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.05 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  34.34 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.49 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  35.95 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  35.86 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  31.92 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.52 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.29 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  34.44 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.58 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  30.02 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  31.4 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  31.18 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  34.58 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  30.86 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.69 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  34.43 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.9 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  33.24 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.66 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  29.58 
 
 		 408 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.87 
 
 		 501 aa  143  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  33.72 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.93 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.64 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.07 
 
 		 409 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.73 
 
 		 407 aa  139  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.44 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  30.84 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  32.51 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.13 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  28.26 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.25 
 
 		 501 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.19 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  30.12 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.44 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  27.16 
 
 		 1016 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  27.38 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  29.24 
 
 		 431 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  27.62 
 
 		 425 aa  109  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  29.77 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.6 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  29.77 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.39 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  30.77 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  27.45 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.45 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  29.52 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  26.2 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  30.31 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  29.15 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  31.49 
 
 		 542 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  27.17 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.19 
 
 		 508 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.09 
 
 		 511 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  27.44 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  26.45 
 
 		 445 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.47 
 
 		 515 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  28.71 
 
 		 546 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  28.16 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  28.57 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.68 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.42 
 
 		 525 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>