More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1278 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  84.99 
 
 		 411 aa  734    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 413 aa  860    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  80.87 
 
 		 411 aa  705    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  80.34 
 
 		 411 aa  698    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  82.08 
 
 		 411 aa  709    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  80.83 
 
 		 411 aa  695    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  65.44 
 
 		 400 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  62.66 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  62.15 
 
 		 403 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  62.3 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  61.13 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  58.72 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  57.99 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  58.72 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  58.23 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  57.99 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  57.99 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  58.23 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  58.23 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  55.64 
 
 		 402 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  59.53 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  57.74 
 
 		 402 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  58.23 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  57.74 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  57.88 
 
 		 382 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  57.88 
 
 		 382 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  53.71 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  58.09 
 
 		 348 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  58.26 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  58.26 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  51.19 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  47.69 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  42 
 
 		 422 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  44.33 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  44.33 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40.6 
 
 		 435 aa  305  7e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  42.15 
 
 		 408 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  41.88 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  61.26 
 
 		 231 aa  291  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  61.97 
 
 		 219 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  38.79 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  38.79 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  36.36 
 
 		 417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.77 
 
 		 396 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  35.1 
 
 		 416 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  35.63 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  34.95 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  34.95 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  35.21 
 
 		 399 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  34.71 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  34.86 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  34.59 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  34.55 
 
 		 370 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.32 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.86 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  34.59 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.03 
 
 		 416 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  34.39 
 
 		 363 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  33.98 
 
 		 424 aa  212  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  34.32 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.32 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.36 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.32 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.32 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  34.32 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  34.32 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.68 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  33.77 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  33.86 
 
 		 363 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.22 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.22 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  33.86 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  32.83 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  33.5 
 
 		 391 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  35 
 
 		 429 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.95 
 
 		 396 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  33.6 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  32.9 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  33.92 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  33.92 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  33.92 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  33.6 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  33.58 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  33.67 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  33.6 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 		 363 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  33.24 
 
 		 363 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 363 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  33.75 
 
 		 384 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  33.25 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.69 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  32.32 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.03 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  33.42 
 
 		 384 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  33.67 
 
 		 384 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  33.16 
 
 		 384 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  33.59 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  34.05 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>