42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0367 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 134 aa  261  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  41.88 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  43.86 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  43.86 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  42.11 
 
 		 120 aa  87.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  37.61 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  37.61 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  42.34 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  40.54 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  41.35 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  37.61 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  39.42 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  36.97 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  37.39 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  39.8 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  39.8 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  36.75 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  35.29 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  34.75 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  34.44 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  33.64 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  32 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  31.9 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  32.22 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  32.22 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  32.22 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  29.55 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  31.62 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  28.41 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  31.68 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  32.95 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  27.56 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  31.91 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  30.85 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  30.85 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  33 
 
 		 165 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  28 
 
 		 125 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  32.95 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1617  roadblock/LC7 domain-contain protein  31.82 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  31.19 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>