More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0358 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  72.42 
 
 		 336 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  69.85 
 
 		 335 aa  484  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  64.86 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  64.17 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  58.75 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  58.44 
 
 		 326 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  57.81 
 
 		 326 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.63 
 
 		 326 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.63 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.63 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.63 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.63 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.63 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.63 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.32 
 
 		 326 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  56.56 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  56.56 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  56.56 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  54.55 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  53.92 
 
 		 325 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  54.23 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  47.11 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  59.9 
 
 		 207 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  40.15 
 
 		 524 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  38.53 
 
 		 402 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  34.18 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  35.38 
 
 		 439 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  33.11 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  35.9 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  35.22 
 
 		 397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  35.22 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  35.22 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  32.4 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  34.97 
 
 		 813 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  30.85 
 
 		 809 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  37.17 
 
 		 932 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  32.78 
 
 		 775 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 793 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  37.66 
 
 		 797 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  37.66 
 
 		 810 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  36.94 
 
 		 800 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  35.14 
 
 		 793 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 806 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  38.92 
 
 		 816 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  35.06 
 
 		 783 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  35.08 
 
 		 809 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 853 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  35.16 
 
 		 806 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  35.33 
 
 		 794 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  37.18 
 
 		 775 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  34.13 
 
 		 813 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  32.99 
 
 		 800 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  36.6 
 
 		 797 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  32.99 
 
 		 800 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 1309 aa  109  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  33.71 
 
 		 787 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  34.16 
 
 		 776 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  34.16 
 
 		 773 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  33.71 
 
 		 756 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  33.12 
 
 		 800 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  34.16 
 
 		 776 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  34.16 
 
 		 776 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  34.16 
 
 		 776 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  34.16 
 
 		 773 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  34.16 
 
 		 776 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  34.16 
 
 		 776 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  34.16 
 
 		 773 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  35.37 
 
 		 811 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 807 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  34.42 
 
 		 802 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  33.54 
 
 		 773 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  34.42 
 
 		 802 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  34.42 
 
 		 802 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  35.06 
 
 		 1104 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  35.4 
 
 		 791 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  29.61 
 
 		 776 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  35.4 
 
 		 791 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  33.54 
 
 		 776 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36 
 
 		 803 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  31.67 
 
 		 781 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2310  ATP-dependent protease La  29.52 
 
 		 769 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  29.61 
 
 		 776 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  35.95 
 
 		 809 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  34.42 
 
 		 805 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 812 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  36.6 
 
 		 793 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 804 aa  106  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 		 802 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  34.38 
 
 		 803 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  31.46 
 
 		 809 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  35.06 
 
 		 805 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  33.52 
 
 		 936 aa  105  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  34.76 
 
 		 818 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  33.52 
 
 		 936 aa  105  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0376  ATP-dependent protease La  28.16 
 
 		 776 aa  105  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  35.95 
 
 		 794 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 772 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>