56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1483 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  100 
 
 		 212 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  64.93 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  59.38 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  57.81 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  58.33 
 
 		 220 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  34.18 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  32.16 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  42.48 
 
 		 626 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  39.56 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  41.28 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  40.91 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  40.46 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  28.99 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  39.89 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  34.62 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  40 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  38.46 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  38.46 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  37.87 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  30.73 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  30.77 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  32.89 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  29.56 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  37.58 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  37.87 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  38.03 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  37.06 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  37.06 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1057  hypothetical protein  34.88 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  37.06 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  36.49 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  29.7 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5175  YhhN family protein  31.96 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  32.04 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  35.88 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  35.88 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  36.97 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  35.88 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  35.88 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  37.66 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  31.9 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  35.88 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  35.88 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  31.94 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  35.29 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0951  YhhN family protein  29.47 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  35.96 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  32.69 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  33.76 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  34.27 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  37.58 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2687  YhhN family protein  33.51 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0177327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  27.67 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  34.78 
 
 		 597 aa  45.1  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  34.78 
 
 		 597 aa  42.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1642  YhhN family protein  24.53 
 
 		 371 aa  41.6  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.450211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>