140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0522 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  100 
 
 
495 aa  1009    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  54.84 
 
 
468 aa  525  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  52.97 
 
 
459 aa  513  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  50.41 
 
 
451 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  49.49 
 
 
450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  47.33 
 
 
462 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  48.08 
 
 
447 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  49.38 
 
 
469 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.68 
 
 
473 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.49 
 
 
452 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  46.47 
 
 
487 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.63 
 
 
449 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  43.35 
 
 
477 aa  352  8.999999999999999e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  43.35 
 
 
477 aa  352  8.999999999999999e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  42.06 
 
 
506 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.17 
 
 
494 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.89 
 
 
448 aa  331  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  41.09 
 
 
464 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.55 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  36.22 
 
 
511 aa  306  5.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  37.87 
 
 
446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  39.68 
 
 
468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.29 
 
 
455 aa  300  4e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.69 
 
 
462 aa  285  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.47 
 
 
476 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.77 
 
 
456 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.39 
 
 
467 aa  263  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  33.8 
 
 
453 aa  256  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37 
 
 
465 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  38.46 
 
 
486 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  38.26 
 
 
486 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  35.9 
 
 
467 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.37 
 
 
490 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  64.5 
 
 
461 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  36.2 
 
 
490 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  32.28 
 
 
493 aa  229  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  35.5 
 
 
496 aa  226  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  36.03 
 
 
493 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  29.22 
 
 
843 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  50.92 
 
 
467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  50.92 
 
 
467 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1907  DNA photolyase, class 2  56.25 
 
 
104 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0237  deoxyribodipyrimidine photolyase-like  46.67 
 
 
114 aa  70.5  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.969227  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.73 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.28 
 
 
499 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.52 
 
 
484 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.08 
 
 
479 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2095  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.59 
 
 
500 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2217  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.57 
 
 
525 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511177  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.24 
 
 
519 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.24 
 
 
519 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.63 
 
 
476 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.19 
 
 
483 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.48 
 
 
479 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.93 
 
 
454 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.31 
 
 
476 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.92 
 
 
483 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  25.69 
 
 
567 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.31 
 
 
476 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.68 
 
 
474 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.7 
 
 
475 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.58 
 
 
476 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.34 
 
 
476 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.11 
 
 
476 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.24 
 
 
487 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.84 
 
 
518 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.36 
 
 
476 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5849  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.36 
 
 
505 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  28.32 
 
 
472 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.62 
 
 
469 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.27 
 
 
469 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.08 
 
 
453 aa  53.9  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2665  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.98 
 
 
501 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  25 
 
 
474 aa  53.5  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0213  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.51 
 
 
477 aa  53.5  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.615271  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0776  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.43 
 
 
479 aa  53.5  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0436296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.09 
 
 
471 aa  53.5  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.89 
 
 
486 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  29.73 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.17 
 
 
475 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.22 
 
 
499 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03081  putative DNA photolyase  24.48 
 
 
477 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.81 
 
 
471 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2196  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.01 
 
 
519 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.5 
 
 
483 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.37 
 
 
505 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03091  putative DNA photolyase  23.69 
 
 
478 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.93 
 
 
500 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.35 
 
 
454 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.58 
 
 
475 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.79 
 
 
449 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  30.93 
 
 
495 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2125  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.71 
 
 
479 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.82 
 
 
497 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.53 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.66 
 
 
492 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.14 
 
 
511 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.01 
 
 
504 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  23.71 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.27 
 
 
482 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>