More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0281 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0281  CBS  100 
 
 
459 aa  942    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  75.49 
 
 
457 aa  701    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  72.21 
 
 
457 aa  687    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  71.12 
 
 
459 aa  691    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  63.68 
 
 
457 aa  617  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  60.18 
 
 
466 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1634  CBS  64.01 
 
 
457 aa  565  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.29 
 
 
453 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  35.28 
 
 
463 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  33.04 
 
 
453 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.21 
 
 
459 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  35.12 
 
 
459 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.35 
 
 
459 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.68 
 
 
496 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.9 
 
 
459 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  31.47 
 
 
461 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  34.36 
 
 
464 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  34.36 
 
 
464 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  34.14 
 
 
464 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  35.16 
 
 
464 aa  259  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  34.42 
 
 
464 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  34.05 
 
 
469 aa  256  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  40.81 
 
 
332 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  33.26 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  34.44 
 
 
464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  34.63 
 
 
463 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  32.47 
 
 
458 aa  252  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  33.26 
 
 
456 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  34.2 
 
 
455 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  33.55 
 
 
455 aa  246  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  32.9 
 
 
454 aa  244  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  33.99 
 
 
460 aa  243  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  33.41 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  33.98 
 
 
458 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  31.48 
 
 
461 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 
456 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  33.91 
 
 
462 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  33.69 
 
 
462 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  32.83 
 
 
457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  31.69 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  33.48 
 
 
456 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  30.82 
 
 
454 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  31.81 
 
 
455 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 
456 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  32.62 
 
 
464 aa  227  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  31.68 
 
 
463 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  32.39 
 
 
459 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  31.84 
 
 
468 aa  226  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  32.89 
 
 
479 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  31.18 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  35.8 
 
 
326 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  33.19 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.59 
 
 
479 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  31.79 
 
 
457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  31.57 
 
 
457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  33.18 
 
 
456 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.09 
 
 
465 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.82 
 
 
346 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.6 
 
 
333 aa  207  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  30.34 
 
 
464 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  34.74 
 
 
345 aa  206  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  31.5 
 
 
454 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.77 
 
 
326 aa  206  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.62 
 
 
326 aa  205  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.4 
 
 
456 aa  203  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  31.24 
 
 
464 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  30.57 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  29.01 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.54 
 
 
455 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.03 
 
 
461 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  35.91 
 
 
521 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  37.21 
 
 
327 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.58 
 
 
461 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  34.26 
 
 
355 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  35.05 
 
 
340 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  33.23 
 
 
324 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  34.07 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.76 
 
 
328 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  33.97 
 
 
326 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  37.82 
 
 
309 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.12 
 
 
325 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  37.37 
 
 
305 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  33.44 
 
 
323 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  33.44 
 
 
323 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  31.97 
 
 
324 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  36.89 
 
 
310 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  31.97 
 
 
324 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  33.23 
 
 
316 aa  183  6e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  35.56 
 
 
311 aa  183  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  33.23 
 
 
316 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  36.56 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  31.61 
 
 
338 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  35.87 
 
 
311 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  36.69 
 
 
309 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  32.26 
 
 
324 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29 
 
 
456 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  36.7 
 
 
311 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  38.49 
 
 
330 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  38.73 
 
 
322 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  28.79 
 
 
456 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>