30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3945 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
540 aa  1098    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  39.05 
 
 
325 aa  214  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  37.77 
 
 
345 aa  202  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  39.62 
 
 
268 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  39.8 
 
 
255 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  39.49 
 
 
257 aa  131  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  40.59 
 
 
352 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  36.27 
 
 
254 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  36.67 
 
 
259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  37.75 
 
 
254 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  36.14 
 
 
247 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  30.59 
 
 
786 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  40.91 
 
 
281 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  33.97 
 
 
255 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  32.84 
 
 
258 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  37.42 
 
 
629 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  38.24 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  34.29 
 
 
628 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  34.39 
 
 
595 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  30.2 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  30.05 
 
 
478 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  32.62 
 
 
322 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  28.4 
 
 
263 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  30.82 
 
 
321 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  32.05 
 
 
326 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.57 
 
 
2449 aa  54.3  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  31.19 
 
 
3471 aa  53.9  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  31.19 
 
 
3472 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  30.28 
 
 
3521 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  31.68 
 
 
3409 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>