More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1686 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1686  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
395 aa  801    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.81 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.8 
 
 
528 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.45 
 
 
466 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.17 
 
 
511 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.45 
 
 
541 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  46.05 
 
 
485 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  45.92 
 
 
529 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.92 
 
 
538 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  45.38 
 
 
528 aa  322  7e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.38 
 
 
525 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.38 
 
 
528 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  45.38 
 
 
528 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  45.38 
 
 
528 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  45.38 
 
 
533 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.38 
 
 
528 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  45.38 
 
 
525 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.89 
 
 
533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.19 
 
 
474 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.96 
 
 
590 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.13 
 
 
482 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  44.84 
 
 
551 aa  318  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.05 
 
 
602 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  45.4 
 
 
527 aa  318  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  45.23 
 
 
521 aa  317  3e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.81 
 
 
564 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.33 
 
 
557 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.33 
 
 
557 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.33 
 
 
557 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.41 
 
 
530 aa  315  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.5 
 
 
597 aa  315  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  44.83 
 
 
601 aa  315  9e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.5 
 
 
584 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.11 
 
 
646 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  42.74 
 
 
445 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.09 
 
 
528 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.09 
 
 
528 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.37 
 
 
609 aa  312  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  46.37 
 
 
609 aa  311  9e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.32 
 
 
405 aa  310  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.92 
 
 
527 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.46 
 
 
559 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.8 
 
 
491 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.39 
 
 
532 aa  310  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.77 
 
 
498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.85 
 
 
531 aa  309  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.06 
 
 
550 aa  309  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.59 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.09 
 
 
494 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.99 
 
 
607 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.88 
 
 
532 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  41.89 
 
 
528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  43.85 
 
 
580 aa  306  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.03 
 
 
452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  43.77 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  43.72 
 
 
530 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.33 
 
 
414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.63 
 
 
451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.16 
 
 
447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.79 
 
 
623 aa  305  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  44.86 
 
 
572 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.79 
 
 
605 aa  306  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.35 
 
 
578 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.71 
 
 
511 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  46.82 
 
 
614 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.35 
 
 
535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.67 
 
 
526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.35 
 
 
549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.67 
 
 
525 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.06 
 
 
451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.67 
 
 
525 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.99 
 
 
513 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.23 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.62 
 
 
549 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  43.85 
 
 
589 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.75 
 
 
637 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.53 
 
 
527 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000199  ATP-dependent RNA helicase  41.8 
 
 
419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00545239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.66 
 
 
457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
589 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.21 
 
 
583 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  44.47 
 
 
656 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  40.76 
 
 
552 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0198  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.95 
 
 
418 aa  302  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.09 
 
 
599 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.78 
 
 
539 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.54 
 
 
610 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.97 
 
 
515 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.82 
 
 
625 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.44 
 
 
621 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.23 
 
 
634 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  44.74 
 
 
590 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.8 
 
 
514 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  41.78 
 
 
398 aa  301  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.94 
 
 
611 aa  300  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  43.58 
 
 
579 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.34 
 
 
622 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.34 
 
 
619 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.77 
 
 
533 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  41.27 
 
 
421 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>