More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1478 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 533 aa  1091    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  45.69 
 
 		 523 aa  483  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  39.86 
 
 		 505 aa  313  5.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  40.37 
 
 		 501 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  40.14 
 
 		 501 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  39.77 
 
 		 501 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  39.31 
 
 		 501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 		 546 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  36.19 
 
 		 490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 494 aa  286  9e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  41.95 
 
 		 488 aa  269  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 688 aa  243  7.999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1219  glycosyl transferase family 2  35.6 
 
 		 439 aa  212  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0285  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18489  predicted protein  30.56 
 
 		 514 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0623702  normal  0.762192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0925  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 586 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 509 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 520 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.17 
 
 		 505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  32.17 
 
 		 520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  32.17 
 
 		 662 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 420 aa  136  9e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  33.46 
 
 		 633 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_25890  predicted protein  30.08 
 
 		 825 aa  127  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.422329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  31 
 
 		 895 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 446 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  28.33 
 
 		 740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 895 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 899 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 919 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 868 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 476 aa  120  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 944 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.43 
 
 		 672 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  33.07 
 
 		 443 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.12 
 
 		 672 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 889 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.24 
 
 		 768 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 889 aa  117  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 889 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  28.1 
 
 		 672 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 476 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  27.48 
 
 		 661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 905 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 475 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 475 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.39 
 
 		 664 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  33.98 
 
 		 458 aa  114  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  30.07 
 
 		 439 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  28.37 
 
 		 716 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.8 
 
 		 718 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  28.72 
 
 		 712 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  29.71 
 
 		 737 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 		 620 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.77 
 
 		 834 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.73 
 
 		 730 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  26.89 
 
 		 666 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.77 
 
 		 831 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  26.47 
 
 		 741 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  29.41 
 
 		 788 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  29.41 
 
 		 788 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  26.21 
 
 		 664 aa  107  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 859 aa  106  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.34 
 
 		 846 aa  106  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 844 aa  106  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.55 
 
 		 851 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.08 
 
 		 822 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.47 
 
 		 842 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 591 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 917 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  30.35 
 
 		 469 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 885 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 857 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  31.03 
 
 		 845 aa  104  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  30.74 
 
 		 749 aa  104  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  29.7 
 
 		 778 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  26.58 
 
 		 872 aa  103  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  27.94 
 
 		 739 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.99 
 
 		 730 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.03 
 
 		 845 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  26.54 
 
 		 707 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  31.03 
 
 		 845 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 610 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 		 848 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 		 848 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  29.17 
 
 		 848 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  29.17 
 
 		 846 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  27.72 
 
 		 899 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>