173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3107 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 447 aa  902    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  37.05 
 
 		 449 aa  276  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  39.65 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  42.62 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  36.29 
 
 		 450 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  36.29 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  36.64 
 
 		 449 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  37.14 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  37.57 
 
 		 457 aa  203  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  32.03 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  34.81 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  35.44 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  34.53 
 
 		 464 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  34.53 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  34.85 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  35.93 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  34.29 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  37.11 
 
 		 476 aa  186  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  33.5 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  34 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  34.17 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  36.22 
 
 		 494 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  36.34 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  34.53 
 
 		 481 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  34.01 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  30.89 
 
 		 456 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  36.87 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  36.06 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  27.27 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 503 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  39.71 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  32.62 
 
 		 503 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  32.62 
 
 		 503 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  30.12 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  33.17 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  34.02 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  29.46 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  32.48 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  29.81 
 
 		 490 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  35.45 
 
 		 477 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.24 
 
 		 449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  33.02 
 
 		 461 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  35.88 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  34.62 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  33.24 
 
 		 471 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  36.62 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  36.34 
 
 		 458 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  33.66 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  35.13 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  35.52 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  35.31 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  35.94 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.39 
 
 		 468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  35.19 
 
 		 456 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  34.32 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  32.75 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  31 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  32.84 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  30.88 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  35.06 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  32.15 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  37.72 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  31.35 
 
 		 456 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  32.02 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  35.31 
 
 		 455 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  38.03 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  32.84 
 
 		 483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  31.53 
 
 		 482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 481 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  33.09 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  34.42 
 
 		 458 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  33.57 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  36.17 
 
 		 453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  33.81 
 
 		 467 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  34.87 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  37.87 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  36.93 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  29.18 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  31.02 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 453 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  30.66 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  31.16 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  31.99 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  32.39 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  34.39 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  34.55 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  32.3 
 
 		 453 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  33.06 
 
 		 439 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  33.6 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  29.79 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  33.24 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  31.58 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  35.55 
 
 		 474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  31.79 
 
 		 462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  31.03 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  29.87 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  30.55 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  29.81 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  29.23 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  27.73 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>