39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1170 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1170  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  393  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  35.48 
 
 		 615 aa  48.5  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 688 aa  48.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  35.23 
 
 		 406 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1144  tetratricopeptide TPR_2  31.13 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  0.0543411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.39 
 
 		 747 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34 
 
 		 653 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1463  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  34.09 
 
 		 406 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1376  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 343 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.12 
 
 		 695 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 750 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5393  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  40.45 
 
 		 472 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.378929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 927 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1340  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 343 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 3145 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1358  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 343 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.36 
 
 		 837 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 860 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  32.91 
 
 		 2679 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 909 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3977  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  39.19 
 
 		 476 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 739 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 612 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 827 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 648 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.9 
 
 		 277 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 208 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 203 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 566 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 166 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 792 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48786  predicted protein  25.6 
 
 		 959 aa  41.6  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0226  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 322 aa  41.6  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 583 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1215  TPR domain-containing protein  40.43 
 
 		 123 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000931471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>