More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0834 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0834  DNA-binding transcriptional activator MhpR  100 
 
 		 264 aa  532  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3062  DNA-binding transcriptional activator MhpR  38.96 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  33.73 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.69 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0269  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.69 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.32 
 
 		 278 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.38 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.89 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.12 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.1 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.65 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.65 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.65 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.65 
 
 		 315 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.65 
 
 		 315 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  34.21 
 
 		 315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  34.21 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  34.21 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1978  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.48 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184195  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0926  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.83 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  32.06 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  29.44 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0051  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.25 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7409  Transcriptional regulator  28.17 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  29.44 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2112  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  26.07 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  33.13 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  27.89 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  31.78 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  29.64 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  25.7 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  29.77 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  26.95 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  29.17 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  33.16 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  27.2 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  26.15 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1537  regulatory protein, IclR  26.95 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  28.3 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  28.1 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.62 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  28.71 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  25.66 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  29.47 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  24.31 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  24.05 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  28.52 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  24.9 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>