43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2479 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  758    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  45.01 
 
 		 362 aa  295  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  43.03 
 
 		 678 aa  271  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  41.25 
 
 		 681 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  40.71 
 
 		 681 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  43.93 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  40.16 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  32.48 
 
 		 590 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  38.54 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 647 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  32.93 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  34.85 
 
 		 756 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  28.91 
 
 		 717 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  29.89 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  32.69 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  34.58 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  31.62 
 
 		 569 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  26.69 
 
 		 679 aa  87  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  32.4 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  25.52 
 
 		 759 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  26.03 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  26.98 
 
 		 728 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  26.61 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  24.77 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  35.51 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  27.6 
 
 		 587 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  30.04 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2962  hypothetical protein  23.22 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2918  hypothetical protein  23.22 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  25.38 
 
 		 667 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  29.83 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3071  hypothetical protein  23.3 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  28.57 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2616  AAA ATPase  26.44 
 
 		 674 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  26.09 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  25.1 
 
 		 720 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  26.24 
 
 		 716 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  28.21 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  30.61 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  35.71 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  22.07 
 
 		 712 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  25.67 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  27.14 
 
 		 666 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>