More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2316 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2316  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  100 
 
 		 298 aa  614  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0946  LysR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1345  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1268  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2443  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.55 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586469  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3485  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0348  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.425258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.31 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002638  putative transcriptional regulator LysR family  34.74 
 
 		 316 aa  158  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0120713  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0381  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2291  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83222 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1385  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.765137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3368  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0491  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.66 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6449  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0248  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 302 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.99 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6156  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0785  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2879  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0586  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1122  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 311 aa  148  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2215  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6398  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1431  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2531  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6443  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226861 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4553  hypothetical protein  33.68 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2267  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000460407  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0246  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3569  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.898807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0921  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4773  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3881  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3108  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  0.186906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2809  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3606  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0491  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1699  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00239277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1449  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4049  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 290 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769313  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2568  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5010  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2586  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0519  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4077  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5707  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0403331 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3770  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4598  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6126  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4639  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5212  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3250  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3957  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5074  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3624  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2214  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3317  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5146  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.981039 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5073  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4485  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3295  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0093  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670224  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0449  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.109175 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1005  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187099  normal  0.59249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3358  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3068  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.66 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5525  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.485988 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4486  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.978726 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0495  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33 
 
 		 301 aa  139  8.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3159  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.789389  normal  0.0875309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0325  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.44 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4588  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.042937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0483  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1246  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1967  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0994  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0840  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1574  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0983  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  29.33 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0698  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3291  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4028  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0083  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.09 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363159  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2120  LysR family regulatory protein  30.61 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4611  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1165  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7121  transcriptional regulator LysR family  31.31 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0306023  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6924  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671942  normal  0.244663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0423  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1384  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259574  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1303  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1035  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2555  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2712  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1281  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0525  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1043  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2783  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.74 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.029199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>