167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1685 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3103  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  44.3 
 
 		 900 aa  712    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1685  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  100 
 
 		 854 aa  1767    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4450  PfaB family protein  29.61 
 
 		 917 aa  353  8e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562083  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  31.06 
 
 		 1107 aa  341  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  30.6 
 
 		 1605 aa  337  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  30.19 
 
 		 1109 aa  325  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2667  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  29.84 
 
 		 768 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2841  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  29.69 
 
 		 754 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1325  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  29.19 
 
 		 769 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1424  PfaB family protein  30.34 
 
 		 725 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1220  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  29.28 
 
 		 697 aa  191  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2734  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  29.64 
 
 		 756 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2930  PfaB family protein  29.77 
 
 		 760 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1418  PfaB family protein  29.42 
 
 		 757 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2908  PfaB family protein  26.92 
 
 		 777 aa  188  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1452  PfaB family protein  30.02 
 
 		 749 aa  188  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3203  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  26.8 
 
 		 765 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1422  PfaB family protein  27.04 
 
 		 756 aa  181  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2666  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  28.83 
 
 		 716 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  28.09 
 
 		 2368 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2628  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  27.91 
 
 		 741 aa  172  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  24.23 
 
 		 2348 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  24.21 
 
 		 2336 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  23.8 
 
 		 2391 aa  146  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  23.97 
 
 		 2396 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  23.93 
 
 		 2553 aa  138  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  24.32 
 
 		 2276 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1114  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  25.21 
 
 		 687 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  21.67 
 
 		 2376 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  22.59 
 
 		 2664 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  21.43 
 
 		 2620 aa  108  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  23.36 
 
 		 2661 aa  107  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  22.37 
 
 		 2764 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  25.89 
 
 		 2882 aa  101  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  23.08 
 
 		 2683 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  23.63 
 
 		 2503 aa  97.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  23.56 
 
 		 2674 aa  92.4  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  22.01 
 
 		 2531 aa  91.7  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  24.92 
 
 		 2249 aa  90.9  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  21.81 
 
 		 2693 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  21.58 
 
 		 2642 aa  89.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  21.62 
 
 		 2704 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  21.65 
 
 		 2694 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  23.22 
 
 		 2275 aa  88.2  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  21.63 
 
 		 2640 aa  87.8  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  22.24 
 
 		 2298 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  23.36 
 
 		 2477 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  22.17 
 
 		 2266 aa  86.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  20.96 
 
 		 2314 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  21.52 
 
 		 2657 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  21.15 
 
 		 1764 aa  83.2  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  21.06 
 
 		 2624 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  20.85 
 
 		 2542 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  21.26 
 
 		 2619 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  21.32 
 
 		 2703 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  21.88 
 
 		 2750 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  20.29 
 
 		 1272 aa  80.9  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  23.87 
 
 		 2614 aa  79  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  22.56 
 
 		 2443 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  22.43 
 
 		 2771 aa  76.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  21.46 
 
 		 2189 aa  76.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  21.79 
 
 		 2316 aa  73.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  21.09 
 
 		 2327 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  20 
 
 		 2300 aa  71.2  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  22.85 
 
 		 3400 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  21.02 
 
 		 2754 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  22.67 
 
 		 2816 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  22.63 
 
 		 2628 aa  68.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  22.66 
 
 		 1845 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  22.09 
 
 		 2386 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  21.08 
 
 		 2414 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  21.56 
 
 		 1631 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  20.78 
 
 		 1349 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  20.43 
 
 		 1349 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  22.09 
 
 		 1530 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  22.09 
 
 		 1530 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  21.13 
 
 		 2260 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  22.13 
 
 		 1528 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1080  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  22.15 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0336623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  20.65 
 
 		 3073 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  21.19 
 
 		 1772 aa  59.3  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0347  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  21.85 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  21.78 
 
 		 2762 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  20.85 
 
 		 1354 aa  57.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1437  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  23.81 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  22.22 
 
 		 2772 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  21.18 
 
 		 4478 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.71 
 
 		 2551 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1644  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  24.77 
 
 		 309 aa  56.2  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  19.05 
 
 		 1413 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.07 
 
 		 1874 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.37 
 
 		 1837 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1289  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  23.17 
 
 		 308 aa  54.7  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.899199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1314  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  23.17 
 
 		 308 aa  54.7  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  25.1 
 
 		 2393 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1666  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  22.99 
 
 		 313 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.048632  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  25 
 
 		 1087 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  22.53 
 
 		 1867 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3100  Acyl transferase  26.38 
 
 		 866 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1343  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  23.5 
 
 		 319 aa  52.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.374742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>