More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0704 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  55.71 
 
 
574 aa  682    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  54.29 
 
 
574 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
569 aa  1174    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  66 
 
 
569 aa  758    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  52.27 
 
 
577 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  52.01 
 
 
577 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  54.03 
 
 
574 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  53.39 
 
 
621 aa  608  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 
572 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  49.03 
 
 
580 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  50.36 
 
 
571 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  50.36 
 
 
571 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  48.11 
 
 
579 aa  545  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  48.29 
 
 
585 aa  524  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  40.07 
 
 
576 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 
596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  39.97 
 
 
576 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 
596 aa  435  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
606 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 
586 aa  428  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 
599 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 
570 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  37.66 
 
 
574 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
610 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
589 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  37.33 
 
 
605 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  35.62 
 
 
590 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  35.47 
 
 
591 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  31.26 
 
 
548 aa  298  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  30.51 
 
 
571 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  27.87 
 
 
556 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  27.32 
 
 
555 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  29.22 
 
 
555 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  28.8 
 
 
559 aa  261  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  29.38 
 
 
595 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  28.03 
 
 
554 aa  258  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  28.67 
 
 
562 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  27.36 
 
 
556 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  26.59 
 
 
556 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  28.36 
 
 
553 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  26.41 
 
 
556 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  29.09 
 
 
533 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  27.56 
 
 
529 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
573 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  29.02 
 
 
563 aa  240  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  28.82 
 
 
565 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 
566 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  28.52 
 
 
582 aa  224  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  27.44 
 
 
594 aa  220  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  27.29 
 
 
580 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  24.41 
 
 
667 aa  177  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  24.3 
 
 
700 aa  174  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.74 
 
 
614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 
328 aa  131  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  27.11 
 
 
705 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.24 
 
 
666 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  29.46 
 
 
634 aa  128  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.63 
 
 
657 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 
439 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  30.25 
 
 
454 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  31.32 
 
 
586 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28 
 
 
627 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 
776 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
657 aa  123  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
657 aa  123  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
657 aa  123  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
657 aa  123  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
657 aa  123  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
657 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 
673 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 
657 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 
657 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  28.95 
 
 
625 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  27.72 
 
 
656 aa  120  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  29.07 
 
 
641 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  35.81 
 
 
503 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.76 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.59 
 
 
668 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 
466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  27.17 
 
 
692 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.95 
 
 
505 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.86 
 
 
863 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 
691 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  25.08 
 
 
485 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 
466 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.76 
 
 
650 aa  116  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.97 
 
 
653 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  28.52 
 
 
325 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  25 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.96 
 
 
916 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.84 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.89 
 
 
598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  25.35 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.52 
 
 
715 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  29.17 
 
 
583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  28.72 
 
 
586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>