More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0416 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 143 aa  297  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  69.12 
 
 		 149 aa  200  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6508  endoribonuclease L-PSP  65.32 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5421  endoribonuclease L-PSP  58.4 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0720  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 129 aa  139  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0884731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2982  putative translation initiation inhibitor  57.72 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6940  Endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0138  endoribonuclease L-PSP  57.48 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0291  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  37.61 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  38.14 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  34.43 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  34.43 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  33.05 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.91 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  33.04 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  29.17 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  30.89 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  32.5 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  36.44 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  34.48 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  37.6 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  34.48 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>