More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4237 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4237  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 350 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2741  protein of unknown function UPF0118  38.24 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000351921  hitchhiker  0.0000000742293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  32.65 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  33.01 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  32.06 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  27.16 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  28.42 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  24.36 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  31.92 
 
 		 392 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  27.85 
 
 		 370 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  23.95 
 
 		 365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  26.54 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.96 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.07 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  24.41 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  26.37 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  25.63 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  25.57 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  24.57 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.09 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  28.51 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  30.53 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 376 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  22.08 
 
 		 394 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  31.1 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  26.99 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  23.89 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  21.83 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  23.51 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  30.39 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  24.37 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  25.33 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  26.3 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  24.76 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  24.76 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  24.05 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  21.88 
 
 		 360 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  23.17 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  24.74 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  25.3 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  31.61 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  24.05 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  23.6 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  24.05 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  32.16 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  24.05 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  30.69 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  24.56 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  27.73 
 
 		 360 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  24.56 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  28.18 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.62 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  25 
 
 		 358 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  28.38 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.59 
 
 		 406 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  24.68 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  24.92 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  26.69 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.59 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  27.76 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  24.68 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  26.01 
 
 		 361 aa  86.3  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  24.92 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  24.92 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  24.92 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  24.92 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  24.92 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  24.92 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  25.6 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  24.92 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  27.66 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  29.74 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  23.46 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  23.87 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  27.87 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  25.4 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4349  hypothetical protein  22.19 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4193  hypothetical protein  22.19 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.662681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  23.34 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4118  hypothetical protein  22.19 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00655828  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  20 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  26.69 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  23.3 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4645  hypothetical protein  27.45 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  22.77 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  26.04 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  21.91 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  29.23 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  31.79 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  23.46 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  21.98 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  25.27 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  20 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  24.52 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0798  protein of unknown function UPF0118  26.78 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>