More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4080 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4080  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
170 aa  348  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1380  NADH dehydrogenase I chain C  50.59 
 
 
175 aa  187  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0753299  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5100  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.6 
 
 
166 aa  178  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4086  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  52.38 
 
 
166 aa  174  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.81 
 
 
173 aa  171  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1244  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  44.97 
 
 
173 aa  155  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.21 
 
 
161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.21 
 
 
161 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  39.16 
 
 
162 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.82 
 
 
230 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.52 
 
 
162 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.13 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  40.26 
 
 
200 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  40.91 
 
 
200 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.56 
 
 
215 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.74 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  40.51 
 
 
201 aa  111  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.33 
 
 
309 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  41.45 
 
 
202 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.33 
 
 
196 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.33 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.33 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.58 
 
 
174 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.33 
 
 
196 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.84 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.01 
 
 
209 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  40.56 
 
 
205 aa  107  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.72 
 
 
212 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.84 
 
 
215 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  40.13 
 
 
202 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.25 
 
 
215 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  40.13 
 
 
202 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.16 
 
 
182 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.26 
 
 
219 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.35 
 
 
204 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49 
 
 
148 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.26 
 
 
219 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.26 
 
 
219 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.67 
 
 
172 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1381  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.58 
 
 
175 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.800351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1280  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.58 
 
 
175 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  39.71 
 
 
284 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  40.52 
 
 
201 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  39.42 
 
 
200 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  36.84 
 
 
202 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.84 
 
 
202 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2568  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.58 
 
 
175 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  35 
 
 
214 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4519  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.1 
 
 
163 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1663  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.9 
 
 
186 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2984  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.33 
 
 
217 aa  101  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  37.75 
 
 
200 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.06 
 
 
787 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  35.81 
 
 
229 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0432  NADH dehydrogenase I, C subunit  39.39 
 
 
186 aa  100  9e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  37.75 
 
 
200 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  37.75 
 
 
200 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  37.75 
 
 
200 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  37.75 
 
 
200 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  37.75 
 
 
200 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  37.09 
 
 
200 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  37.75 
 
 
200 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  37.75 
 
 
200 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  44.83 
 
 
290 aa  99.8  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  36.13 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  37.84 
 
 
215 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  36.49 
 
 
213 aa  99  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  36.99 
 
 
208 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  39.46 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  34.46 
 
 
200 aa  97.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  34.46 
 
 
200 aa  97.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2834  NADH dehydrogenase I chain C  32.2 
 
 
227 aa  97.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.37 
 
 
205 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.62 
 
 
197 aa  97.4  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  35.06 
 
 
200 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.64 
 
 
187 aa  97.1  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1281  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 
208 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5178  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.67 
 
 
203 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  36.18 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  37.5 
 
 
250 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  37.5 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2703  NADH dehydrogenase I chain C  31.64 
 
 
227 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  39.26 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  33.77 
 
 
225 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  34.84 
 
 
206 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  36.42 
 
 
200 aa  95.5  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  36.6 
 
 
245 aa  94.4  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1345  NADH dehydrogenase subunit C  35.76 
 
 
200 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229518  hitchhiker  0.00575892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  34.46 
 
 
201 aa  94.7  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0484  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.68 
 
 
209 aa  94.4  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  36.36 
 
 
206 aa  94  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0988  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.16 
 
 
239 aa  94  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1265  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.4 
 
 
202 aa  94  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  30.11 
 
 
227 aa  94  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.14 
 
 
248 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74163  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial precursor  37.9 
 
 
281 aa  93.6  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0353139  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  34.84 
 
 
204 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  30.11 
 
 
227 aa  94  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  34.9 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>