More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2319 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
316 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  58.84 
 
 
315 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  41.59 
 
 
319 aa  269  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  35.26 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  35.81 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  32.6 
 
 
297 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  33.98 
 
 
299 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  33.33 
 
 
298 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  32.91 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  33.23 
 
 
298 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  35.81 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  31.66 
 
 
297 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  31.66 
 
 
297 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  31.66 
 
 
297 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  31.66 
 
 
297 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  31.66 
 
 
297 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  32.29 
 
 
297 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  31.97 
 
 
297 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  32.51 
 
 
302 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  31.35 
 
 
297 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  33.13 
 
 
301 aa  159  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  31.35 
 
 
297 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  31.66 
 
 
297 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  33.97 
 
 
307 aa  159  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  32.57 
 
 
306 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  33.55 
 
 
299 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  32.18 
 
 
303 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  32.37 
 
 
302 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  32.37 
 
 
302 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  34.19 
 
 
308 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  29.47 
 
 
302 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  30.31 
 
 
299 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  31.19 
 
 
301 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  31.83 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  30.94 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  37.27 
 
 
398 aa  146  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  31.9 
 
 
306 aa  146  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  30.46 
 
 
296 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  29.11 
 
 
305 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  34.66 
 
 
351 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  30.79 
 
 
341 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  29.78 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  30.35 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  29.81 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  28.25 
 
 
304 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  29.81 
 
 
306 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  34.05 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  31.83 
 
 
310 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  30.32 
 
 
307 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  31.36 
 
 
306 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.52 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  28.21 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.43 
 
 
315 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.21 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  28.62 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  31.02 
 
 
301 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  29.28 
 
 
307 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  29.52 
 
 
311 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  28.17 
 
 
309 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  29.62 
 
 
282 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.17 
 
 
309 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  28.7 
 
 
311 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  27.56 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  27.76 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  34.06 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  29.02 
 
 
319 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  29.26 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  29.26 
 
 
306 aa  116  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  29.43 
 
 
309 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  30.23 
 
 
309 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  28.62 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  28.53 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  29.24 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  28.62 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  25.88 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  29.41 
 
 
318 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  29.75 
 
 
327 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  29.37 
 
 
317 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  33.04 
 
 
324 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  31.73 
 
 
326 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  32.29 
 
 
309 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  27.59 
 
 
328 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  28.12 
 
 
328 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  27.39 
 
 
325 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  27.22 
 
 
331 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  25.9 
 
 
308 aa  102  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  27.69 
 
 
308 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  32.24 
 
 
309 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  26.1 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  27.97 
 
 
416 aa  92.8  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  31.39 
 
 
308 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  31.22 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  30.59 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  27.16 
 
 
401 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  26.36 
 
 
309 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.84 
 
 
337 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  25.82 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1433  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.31 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455111  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  26.13 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  25.68 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>