More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0856 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
348 aa  721    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0509  glycosyl transferase group 1  46.96 
 
 
349 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  47.94 
 
 
344 aa  335  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  45.38 
 
 
347 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  39.15 
 
 
356 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2517  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
356 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0975  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
356 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
370 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
370 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
376 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
371 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
400 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
366 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  26.9 
 
 
374 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
374 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
382 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
384 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
431 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  25.13 
 
 
380 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
394 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
397 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
343 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
372 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
377 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
394 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
364 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
361 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  32.7 
 
 
430 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
364 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
393 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
382 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
368 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
376 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
355 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
373 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  26.17 
 
 
373 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
524 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
378 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
381 aa  106  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
395 aa  106  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
384 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
376 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
386 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
380 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
381 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
387 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
360 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
387 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
382 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  24.24 
 
 
361 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  31.58 
 
 
337 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
380 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01924  hypothetical protein  30.41 
 
 
260 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  24.87 
 
 
381 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
369 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
373 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  31.58 
 
 
337 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
370 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01937  putative glycosyltransferase WbbC  30.99 
 
 
370 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3184  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
337 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.262966  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
1261 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
366 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
378 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
382 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
355 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
359 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.65 
 
 
375 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
359 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
672 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
359 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  22.51 
 
 
375 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
349 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  26.73 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  26.26 
 
 
373 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
378 aa  99.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
428 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
367 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
375 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
384 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.46 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
831 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  22.51 
 
 
375 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
382 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
393 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
417 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>