166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4765 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 
199 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  69.9 
 
 
215 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  70.62 
 
 
205 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  68.56 
 
 
202 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  62.96 
 
 
208 aa  263  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.55 
 
 
193 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.55 
 
 
225 aa  207  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.33 
 
 
192 aa  204  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  54.5 
 
 
196 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  54.5 
 
 
196 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  54.5 
 
 
196 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  55.43 
 
 
189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  50.76 
 
 
197 aa  197  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  53.19 
 
 
201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  53.19 
 
 
201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  53.19 
 
 
201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  54.97 
 
 
192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  52.15 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.65 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  51.4 
 
 
194 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  52.38 
 
 
194 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  51.61 
 
 
194 aa  194  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  48.11 
 
 
195 aa  194  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  51.87 
 
 
194 aa  194  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.04 
 
 
195 aa  191  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  51.85 
 
 
192 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  49.21 
 
 
190 aa  184  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  49.73 
 
 
198 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  46.81 
 
 
189 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  46.81 
 
 
189 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  46.81 
 
 
189 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  45.13 
 
 
194 aa  177  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.4 
 
 
189 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  48.4 
 
 
189 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  46.28 
 
 
189 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  47.34 
 
 
189 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.73 
 
 
192 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.17 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  35.11 
 
 
178 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  35.71 
 
 
177 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.8 
 
 
176 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  33.86 
 
 
177 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  32.97 
 
 
178 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  32.46 
 
 
176 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.29 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.91 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  30.85 
 
 
188 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.09 
 
 
189 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  46.07 
 
 
118 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  30.69 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  30.43 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.11 
 
 
185 aa  92.8  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.24 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  31.09 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.11 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  31.05 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  32.11 
 
 
185 aa  89.4  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  31.52 
 
 
186 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.52 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  31.09 
 
 
185 aa  85.9  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.11 
 
 
186 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.91 
 
 
180 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.97 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  41.03 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  30.98 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  28.72 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  34.13 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  31.67 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  28.21 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  32.07 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  32.41 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  30.46 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.83 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  29.37 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.55 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  30.07 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  33.11 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  29.86 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.88 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  30.49 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  31.94 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  32.46 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  28.05 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.11 
 
 
123 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.69 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.99 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.77 
 
 
189 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.57 
 
 
215 aa  61.6  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  25.35 
 
 
184 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  30.18 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  32.26 
 
 
164 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.87 
 
 
215 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  26.16 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.61 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  26.04 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  26.04 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1499  FMN-binding protein  24.55 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.23332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>