129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1513 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  839    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  76.9 
 
 		 407 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  60.45 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  62.43 
 
 		 373 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  55.88 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  50.61 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  50.25 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  54.52 
 
 		 438 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  52.46 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  52.33 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  51.72 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  50.74 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  49.01 
 
 		 411 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  50.99 
 
 		 409 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  50 
 
 		 411 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  46.8 
 
 		 413 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  46.55 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  49.13 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  52.68 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  48.89 
 
 		 407 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  48.16 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  50.37 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  46.42 
 
 		 420 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  45.93 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  45.68 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  46.19 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  45.19 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  45.83 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  44.94 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  44.94 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  44.94 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  46.91 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  44.69 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  43.46 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  43.49 
 
 		 413 aa  333  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  43.53 
 
 		 415 aa  324  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  43.1 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  40.15 
 
 		 409 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  42.86 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  40.4 
 
 		 410 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  41.54 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  40.15 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  33.25 
 
 		 407 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  33.58 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  33.58 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  32.76 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.77 
 
 		 421 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  34.39 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  31.53 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  29.31 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  30.65 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  30.65 
 
 		 400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  26.98 
 
 		 436 aa  189  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  27.57 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25.06 
 
 		 409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  27.99 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  30.42 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  25.71 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  24.93 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  24.93 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  25.44 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  32.16 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 383 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  28.03 
 
 		 376 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  26.46 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  24.09 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  27.69 
 
 		 817 aa  97.8  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  23.6 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  30.49 
 
 		 178 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  23.73 
 
 		 391 aa  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  25.55 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  22.8 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  22.32 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  23.18 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  27.69 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  21.93 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  23.31 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  23.89 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  19.89 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  27.17 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.45 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  22.8 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  35 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.97 
 
 		 310 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  22.13 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  19.53 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  26.88 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.06 
 
 		 277 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  26.63 
 
 		 244 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 		 1177 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33332  predicted protein  20.33 
 
 		 430 aa  49.7  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 282 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 		 1177 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  19.38 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.39 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.56 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>