More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1228 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1228  OmpA/MotB  100 
 
 		 364 aa  712    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4117  ompA family protein  62.54 
 
 		 381 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3854  OmpA/MotB  61.9 
 
 		 386 aa  358  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0341238  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4287  OmpA/MotB domain-containing protein  57.69 
 
 		 325 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1149  OmpA/MotB domain-containing protein  57.84 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.825601  normal  0.159569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1164  OmpA/MotB domain-containing protein  55.86 
 
 		 325 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1128  OmpA/MotB domain protein  57.05 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1435  OmpA/MotB domain-containing protein  61.93 
 
 		 217 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.83553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4332  hypothetical protein  43.84 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50810  hypothetical protein  43.84 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19490  outer membrane protein, OmpA/MotB family  51.81 
 
 		 215 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 220 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 220 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 220 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 220 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 220 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 219 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 219 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 219 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 219 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 219 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 219 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 219 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 219 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  34.29 
 
 		 219 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 220 aa  90.1  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  36.43 
 
 		 222 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 220 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 227 aa  86.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  34.25 
 
 		 248 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.57 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  35 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  34.27 
 
 		 218 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  31.88 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  31.88 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  33.57 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  35.16 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  39.64 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  34.51 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  35.21 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  32.86 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  36.88 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  39.47 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  32.61 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  34.72 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  34.51 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  41.86 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  31.47 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  31.88 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  32.86 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  31.47 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  32.86 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.21 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  33.57 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  30.43 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  31.16 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  49.41 
 
 		 890 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  37.07 
 
 		 533 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  37.41 
 
 		 228 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  34.29 
 
 		 241 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 623 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 		 228 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.89 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  34.82 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  33.57 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  31.47 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.84 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  32.14 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  34.82 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  32.17 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  38.3 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  32.19 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  41.25 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  32.17 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  33.93 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  31.47 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.86 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  38.71 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  41.88 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  32.39 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  30.88 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>