57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0177 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2131  outer membrane protein  44.17 
 
 		 822 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2141  outer membrane protein  44.17 
 
 		 822 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.115838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0177  outer membrane protein PgaA  100 
 
 		 826 aa  1669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.541075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2241  outer membrane protein  44.19 
 
 		 824 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2572  outer membrane protein PgaA  39.85 
 
 		 807 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.014315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01026  predicted outer membrane protein  39.85 
 
 		 807 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01033  hypothetical protein  39.85 
 
 		 807 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1266  outer membrane protein PgaA  39.85 
 
 		 807 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.632553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1144  outer membrane protein PgaA  39.73 
 
 		 807 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4606  outer membrane protein PgaA  38.86 
 
 		 820 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4285  outer membrane protein PgaA  38.21 
 
 		 820 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2792  hypothetical protein  31.31 
 
 		 802 aa  306  9.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214855  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0137  biofilm PGA synthesis protein PgaA precursor  29.21 
 
 		 798 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.764186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2716  HmsH protein  27.98 
 
 		 675 aa  160  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04328  HmsH  28.07 
 
 		 680 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000786393  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4482  hypothetical protein  25.87 
 
 		 797 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.285214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0286  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  26.02 
 
 		 816 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0121559  normal  0.150632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1940  hypothetical protein  24.96 
 
 		 895 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3766  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  24.79 
 
 		 821 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4843  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  24.79 
 
 		 821 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4262  hypothetical protein  23.53 
 
 		 855 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667534  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4104  hypothetical protein  23.53 
 
 		 876 aa  127  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.81202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3419  hypothetical protein  23.69 
 
 		 876 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3515  hypothetical protein  23.88 
 
 		 954 aa  119  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3998  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1018 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706875  normal  0.141155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 673 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 1486 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.82 
 
 		 764 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 612 aa  49.7  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  32.76 
 
 		 379 aa  47.8  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 274 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  36.84 
 
 		 587 aa  47.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.65 
 
 		 622 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  33.72 
 
 		 762 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  33.72 
 
 		 762 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 330 aa  46.6  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 698 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 		 836 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 565 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 4079 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 4489 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 		 1600 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 1737 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 326 aa  46.2  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1138 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.11 
 
 		 725 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 766 aa  45.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.01 
 
 		 632 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  28.89 
 
 		 417 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 467 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 505 aa  45.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  31.18 
 
 		 652 aa  45.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.25 
 
 		 810 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 		 274 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 465 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.14 
 
 		 274 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 274 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>