25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4285 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2241  outer membrane protein  44.43 
 
 		 824 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4606  outer membrane protein PgaA  86.59 
 
 		 820 aa  1466    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4285  outer membrane protein PgaA  100 
 
 		 820 aa  1676    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2141  outer membrane protein  44.66 
 
 		 822 aa  715    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.115838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2131  outer membrane protein  44.54 
 
 		 822 aa  713    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01033  hypothetical protein  41.72 
 
 		 807 aa  601  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01026  predicted outer membrane protein  41.72 
 
 		 807 aa  601  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2572  outer membrane protein PgaA  41.72 
 
 		 807 aa  601  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.014315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1266  outer membrane protein PgaA  41.72 
 
 		 807 aa  601  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.632553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1144  outer membrane protein PgaA  41.47 
 
 		 807 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0177  outer membrane protein PgaA  37.89 
 
 		 826 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.541075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2792  hypothetical protein  30.19 
 
 		 802 aa  272  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2716  HmsH protein  28.74 
 
 		 675 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04328  HmsH  27.51 
 
 		 680 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000786393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0137  biofilm PGA synthesis protein PgaA precursor  27 
 
 		 798 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.764186  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0286  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  25.45 
 
 		 816 aa  129  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0121559  normal  0.150632 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3766  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  23.21 
 
 		 821 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4843  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  23.21 
 
 		 821 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4482  hypothetical protein  22.84 
 
 		 797 aa  119  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.285214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4262  hypothetical protein  23.46 
 
 		 855 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667534  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4104  hypothetical protein  23.89 
 
 		 876 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.81202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3419  hypothetical protein  23.89 
 
 		 876 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1940  hypothetical protein  24.12 
 
 		 895 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3515  hypothetical protein  23.79 
 
 		 954 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3998  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1018 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706875  normal  0.141155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>