28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3998 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3998  hypothetical protein  100 
 
 		 1018 aa  2048    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706875  normal  0.141155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3419  hypothetical protein  80.28 
 
 		 876 aa  1299    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4482  hypothetical protein  73.33 
 
 		 797 aa  1092    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.285214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1940  hypothetical protein  82.05 
 
 		 895 aa  1319    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4262  hypothetical protein  89.61 
 
 		 855 aa  1265    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667534  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3515  hypothetical protein  84.44 
 
 		 954 aa  1645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4104  hypothetical protein  80.17 
 
 		 876 aa  1298    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.81202 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0286  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  36.15 
 
 		 816 aa  416  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0121559  normal  0.150632 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4843  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  36.09 
 
 		 821 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3766  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  36.09 
 
 		 821 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2792  hypothetical protein  25.95 
 
 		 802 aa  173  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0177  outer membrane protein PgaA  23.4 
 
 		 826 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.541075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2141  outer membrane protein  24.87 
 
 		 822 aa  118  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.115838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2131  outer membrane protein  27.72 
 
 		 822 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2241  outer membrane protein  24.74 
 
 		 824 aa  111  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4285  outer membrane protein PgaA  24.88 
 
 		 820 aa  111  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04328  HmsH  23.04 
 
 		 680 aa  111  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000786393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2716  HmsH protein  27.11 
 
 		 675 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0137  biofilm PGA synthesis protein PgaA precursor  23.09 
 
 		 798 aa  102  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.764186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4606  outer membrane protein PgaA  23.18 
 
 		 820 aa  88.2  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01033  hypothetical protein  23.53 
 
 		 807 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2572  outer membrane protein PgaA  23.53 
 
 		 807 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.014315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1266  outer membrane protein PgaA  23.53 
 
 		 807 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.632553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01026  predicted outer membrane protein  23.53 
 
 		 807 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1144  outer membrane protein PgaA  23.53 
 
 		 807 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  32 
 
 		 491 aa  55.5  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9097  hypothetical protein  33.81 
 
 		 3151 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  34.04 
 
 		 533 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>