38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4178 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 253 aa  490  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  96.44 
 
 		 257 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  45.2 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  39.34 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  38.52 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  42.68 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  38.52 
 
 		 252 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  38.52 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  39.84 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  39.84 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  39.02 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  37.7 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  36.14 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  39.02 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  38.04 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  34.55 
 
 		 197 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  43.14 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  27.43 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  24.38 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  23.86 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  29.03 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  27.71 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  24.89 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  25.55 
 
 		 343 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  25.22 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  40.68 
 
 		 59 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  22.4 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  27.1 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  22.83 
 
 		 344 aa  45.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  26 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2628  adenylosuccinate synthetase  32 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  25.79 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  27.31 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  21.31 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  26.35 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  24.46 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  28.57 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  21.08 
 
 		 264 aa  42  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>