More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3139 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  100 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  97.99 
 
 		 298 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  83.22 
 
 		 298 aa  524  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  84.7 
 
 		 297 aa  508  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  80.66 
 
 		 305 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  80.66 
 
 		 305 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  80.66 
 
 		 305 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  78.81 
 
 		 302 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  78.81 
 
 		 302 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  78.81 
 
 		 302 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  78.81 
 
 		 302 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  78.81 
 
 		 302 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  78.41 
 
 		 301 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  83.88 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  79.8 
 
 		 302 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  83.88 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  80.7 
 
 		 298 aa  485  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  83.52 
 
 		 302 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  83.52 
 
 		 302 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  83.52 
 
 		 302 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  83.15 
 
 		 302 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  82.78 
 
 		 302 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  70.81 
 
 		 297 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  73.38 
 
 		 302 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  69.13 
 
 		 297 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  69.13 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  69.46 
 
 		 298 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  69.13 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  69.8 
 
 		 297 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  70.47 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  69.8 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  70.47 
 
 		 297 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  70.47 
 
 		 297 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  69.46 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  70 
 
 		 297 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  68.57 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  68.57 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  63.09 
 
 		 313 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  61.87 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  62.21 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  63.12 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  63.12 
 
 		 302 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  60.48 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  59.8 
 
 		 298 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  59.8 
 
 		 298 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  63.24 
 
 		 298 aa  363  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  61.03 
 
 		 298 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  61.03 
 
 		 298 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  61.03 
 
 		 298 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  59.14 
 
 		 299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  59.72 
 
 		 302 aa  355  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  56.67 
 
 		 302 aa  355  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  61.85 
 
 		 302 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  59.72 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  56.95 
 
 		 306 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  61.25 
 
 		 359 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  61.25 
 
 		 299 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  61.25 
 
 		 299 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  61.25 
 
 		 299 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  56.46 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  61.25 
 
 		 299 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  61.25 
 
 		 298 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  61.25 
 
 		 298 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  55.48 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  55.36 
 
 		 301 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4535  extracellular solute-binding protein  63.04 
 
 		 304 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223425  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  56.38 
 
 		 306 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  60.28 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  59.25 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  55.67 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4341  extracellular solute-binding protein  60.64 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  60.28 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  55.4 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  58.9 
 
 		 302 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  59.25 
 
 		 302 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  60.52 
 
 		 299 aa  342  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  57.04 
 
 		 330 aa  341  7e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  56.54 
 
 		 334 aa  341  9e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  59.78 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  52.86 
 
 		 301 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1100  extracellular solute-binding protein  59.57 
 
 		 305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  57.14 
 
 		 306 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  57.14 
 
 		 306 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  56.8 
 
 		 306 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  53.16 
 
 		 302 aa  330  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  57.6 
 
 		 307 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  56.84 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  57.62 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  55.9 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  55.56 
 
 		 299 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  53.24 
 
 		 302 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  53.61 
 
 		 304 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0906  extracellular solute-binding protein  52.16 
 
 		 304 aa  311  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425834  normal  0.179529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2829  extracellular solute-binding protein family 3  48.81 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.0146067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4477  extracellular solute-binding protein family 3  52.2 
 
 		 301 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  53.05 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  51.86 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  53.21 
 
 		 296 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5289  extracellular solute-binding protein  51.9 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  54.07 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>