144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0697 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0697  domain of unknown function DUF1738  100 
 
 
653 aa  1350    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3365  hypothetical protein  42.6 
 
 
230 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.75727  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5237  hypothetical protein  44.98 
 
 
310 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1595  hypothetical protein  44.98 
 
 
310 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6243  hypothetical protein  39.92 
 
 
297 aa  177  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6530  hypothetical protein  34.01 
 
 
345 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634262  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5209  hypothetical protein  36.84 
 
 
267 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.767147  normal  0.342725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4055  hypothetical protein  42.62 
 
 
188 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5588  hypothetical protein  33.2 
 
 
333 aa  144  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  32.31 
 
 
317 aa  112  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  31.88 
 
 
317 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  31.91 
 
 
326 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  30.59 
 
 
320 aa  108  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  31.63 
 
 
315 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  28.66 
 
 
336 aa  103  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  28.29 
 
 
335 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  28.42 
 
 
328 aa  100  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  28.39 
 
 
323 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  28.83 
 
 
275 aa  98.2  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  29.51 
 
 
318 aa  97.8  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2287  hypothetical protein  28.18 
 
 
239 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1327  hypothetical protein  28.18 
 
 
239 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0330254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1712  hypothetical protein  28.18 
 
 
239 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  27.3 
 
 
344 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  29.22 
 
 
316 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  27.92 
 
 
332 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  27.92 
 
 
332 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  31.77 
 
 
321 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  28.21 
 
 
319 aa  94.7  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  27.99 
 
 
321 aa  94.4  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  28.23 
 
 
312 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  29.33 
 
 
311 aa  94.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  27.55 
 
 
332 aa  94.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  27.53 
 
 
294 aa  94.4  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  26.05 
 
 
322 aa  93.6  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  27.55 
 
 
312 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  27.81 
 
 
320 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  27.92 
 
 
434 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  30.18 
 
 
322 aa  91.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  28.74 
 
 
295 aa  90.5  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  27.27 
 
 
320 aa  90.1  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  27.27 
 
 
320 aa  90.1  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  26.32 
 
 
333 aa  89.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  29.05 
 
 
285 aa  88.2  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  28.42 
 
 
306 aa  87.8  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  28.16 
 
 
314 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  26.5 
 
 
319 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  27.46 
 
 
310 aa  86.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  29.57 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  28.28 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  26.3 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  28.76 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  27.24 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  30.18 
 
 
241 aa  84  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  25.69 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  27.74 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  28.46 
 
 
312 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  27.11 
 
 
318 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  27.94 
 
 
260 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  27.4 
 
 
306 aa  79  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  26.05 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  26.05 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  24.83 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  24.91 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  28.46 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  29.27 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  25.71 
 
 
1077 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  27.34 
 
 
308 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  28.81 
 
 
247 aa  75.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  25.74 
 
 
311 aa  76.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  25.18 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  26.87 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  27.07 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  27.46 
 
 
316 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  26.62 
 
 
288 aa  72  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  26.64 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  28.3 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  27.27 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  29.51 
 
 
258 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  27.03 
 
 
301 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  23.68 
 
 
1580 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  23.1 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  25.58 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  25.27 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  23.05 
 
 
660 aa  67.4  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  25.09 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  24.23 
 
 
297 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  24.32 
 
 
1448 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  26.01 
 
 
304 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  25 
 
 
1448 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  24.3 
 
 
296 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  24.15 
 
 
300 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  26.37 
 
 
1495 aa  66.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  27.08 
 
 
313 aa  65.1  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  24.66 
 
 
300 aa  65.1  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  24.83 
 
 
299 aa  64.7  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  24.5 
 
 
986 aa  64.3  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  23 
 
 
319 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  24.91 
 
 
312 aa  64.3  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  26.71 
 
 
311 aa  63.9  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>