35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6530 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6530  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  717    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5588  hypothetical protein  52.86 
 
 		 333 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6243  hypothetical protein  57.19 
 
 		 297 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5237  hypothetical protein  56.52 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1595  hypothetical protein  56.52 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5209  hypothetical protein  43.27 
 
 		 267 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.767147  normal  0.342725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0697  domain of unknown function DUF1738  33.85 
 
 		 653 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3365  hypothetical protein  34.44 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.75727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4055  hypothetical protein  39.38 
 
 		 188 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2287  hypothetical protein  29.1 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1712  hypothetical protein  29.1 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1327  hypothetical protein  29.1 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0330254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  27.1 
 
 		 673 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  26.04 
 
 		 528 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  35.71 
 
 		 526 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  27.62 
 
 		 673 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  32.26 
 
 		 527 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  31.65 
 
 		 574 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.35 
 
 		 533 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3385  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  32.67 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2727  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  32.69 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000895401  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  31.48 
 
 		 709 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 508 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  35.59 
 
 		 569 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  37.14 
 
 		 496 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  34.57 
 
 		 544 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  24.79 
 
 		 799 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.58 
 
 		 587 aa  43.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  25.89 
 
 		 662 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  37.88 
 
 		 554 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  34.18 
 
 		 498 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  27.38 
 
 		 809 aa  43.1  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.33 
 
 		 462 aa  42.7  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  30.38 
 
 		 574 aa  42.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  24.03 
 
 		 505 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>