22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3365 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3365  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  484  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.75727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4055  hypothetical protein  52.46 
 
 		 188 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0697  domain of unknown function DUF1738  42.6 
 
 		 653 aa  185  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5237  hypothetical protein  37.77 
 
 		 310 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1595  hypothetical protein  37.77 
 
 		 310 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5209  hypothetical protein  38.57 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.767147  normal  0.342725 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6243  hypothetical protein  35.78 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6530  hypothetical protein  34.45 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5588  hypothetical protein  34.44 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2287  hypothetical protein  28.83 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1712  hypothetical protein  28.83 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1327  hypothetical protein  28.83 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0330254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2727  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  30.19 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000895401  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  23.08 
 
 		 495 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  23.08 
 
 		 495 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  26.62 
 
 		 809 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  33.06 
 
 		 799 aa  45.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3385  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.3 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  28.24 
 
 		 493 aa  45.1  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  31.73 
 
 		 871 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  26.45 
 
 		 709 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  24.07 
 
 		 522 aa  41.6  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>