33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5588 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5588  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6530  hypothetical protein  53.03 
 
 
345 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634262  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6243  hypothetical protein  54.21 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1595  hypothetical protein  45.35 
 
 
310 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5237  hypothetical protein  45.35 
 
 
310 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5209  hypothetical protein  44.03 
 
 
267 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.767147  normal  0.342725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0697  domain of unknown function DUF1738  33.2 
 
 
653 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3365  hypothetical protein  34.44 
 
 
230 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.75727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2287  hypothetical protein  31.69 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1327  hypothetical protein  31.69 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0330254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1712  hypothetical protein  31.69 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4055  hypothetical protein  32.29 
 
 
188 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  25.49 
 
 
673 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  29.6 
 
 
520 aa  50.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  28.85 
 
 
673 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  30.85 
 
 
489 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 
662 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  26.88 
 
 
528 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  24.31 
 
 
799 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  36.99 
 
 
527 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  34.48 
 
 
569 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  31.52 
 
 
526 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  28.36 
 
 
519 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.69 
 
 
462 aa  44.3  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  23.44 
 
 
709 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  26.89 
 
 
910 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  27.27 
 
 
799 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2274  type I restriction-modification system DNA methylase  24.31 
 
 
527 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  34.34 
 
 
526 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  26.89 
 
 
863 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  31.65 
 
 
728 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2182  type I restriction-modification system, M subunit  24.31 
 
 
527 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  36.99 
 
 
498 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>