48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1702 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1702  PimS2 protein  100 
 
 		 416 aa  784    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.665919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  32.49 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  35.26 
 
 		 447 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  33.98 
 
 		 430 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  30.85 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  28.21 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  29.74 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.83 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.06 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.91 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  27.59 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  31.52 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.73 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 424 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  24.69 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  35.65 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  28.19 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.71 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  33.74 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.76 
 
 		 444 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  27.6 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.48 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  31.62 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  25.07 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  31.67 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  20.19 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  33.53 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5077  hypothetical protein  29.49 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192036  normal  0.166404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.1 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  22.91 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  34.55 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  26.77 
 
 		 480 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  26.83 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  22.91 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  24.85 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  42.86 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  31.03 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 383 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  33.33 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  34.9 
 
 		 413 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  27.84 
 
 		 317 aa  43.1  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>