More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0693 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 341 aa  671    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.7 
 
 		 341 aa  554  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0553  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.11 
 
 		 341 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.11 
 
 		 341 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  81.71 
 
 		 339 aa  550  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.42 
 
 		 357 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.06 
 
 		 344 aa  535  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.86 
 
 		 345 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.99 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.62 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.99 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.62 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.12 
 
 		 346 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.52 
 
 		 346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.52 
 
 		 346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.98 
 
 		 369 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.92 
 
 		 343 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1638  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.71 
 
 		 348 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.82 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.08 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.85 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.85 
 
 		 349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.97 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.06 
 
 		 359 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.75 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.96 
 
 		 349 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5310  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.36 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.47 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.26 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5235  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.17 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4436  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.36 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4768  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.17 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.26 
 
 		 351 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.09 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.87 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.52 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.21 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.87 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.46 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2724  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.41 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1216  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.23 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.814264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2422  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.22 
 
 		 352 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.06 
 
 		 352 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.12 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.73 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2904  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.19 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.19 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.8 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.07 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.74 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.74 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.48 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.06 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 321 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.88 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1267  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.7 
 
 		 327 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.330108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.42 
 
 		 345 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.25 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.95 
 
 		 353 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.21 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.52 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.22 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.52 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3205  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.34 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.06 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.26 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.38 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.68 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 334 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.46 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.98 
 
 		 345 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.55 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>