258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1299 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  510  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  52.08 
 
 		 245 aa  231  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.62 
 
 		 273 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.28 
 
 		 285 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.43 
 
 		 285 aa  221  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  52.24 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.84 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.72 
 
 		 273 aa  208  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.16 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.9 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  43.75 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  44.21 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.67 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.04 
 
 		 287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  43.78 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  45.45 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.15 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.72 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.35 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.72 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1684  condensin subunit ScpA  45.33 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.35 
 
 		 281 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2172  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.19 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.991171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2261  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.19 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.315795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  44.26 
 
 		 249 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  40.47 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  43.35 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  43.35 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  40.65 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  40.65 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  40.24 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  40.08 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  42.28 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  40.08 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  45.85 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  40.24 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  40.24 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  40.24 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  45.02 
 
 		 296 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  39.32 
 
 		 239 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  40.24 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  43.35 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.92 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.61 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.96 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  40.96 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  42.61 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.82 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  41.18 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  39.84 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.42 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.61 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.63 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  39.76 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.17 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  40.91 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.99 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.84 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.85 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.65 
 
 		 285 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.76 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  40.26 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  40.26 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.79 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  36.32 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  40.26 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  40.26 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  40.26 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  40.26 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  40.26 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  40 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.43 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  40 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.74 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.26 
 
 		 238 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  40.26 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.39 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.91 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.83 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.21 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.91 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.91 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.39 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.39 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  39.57 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  39.39 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.83 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.71 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.83 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.83 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  36.99 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  39.57 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.57 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  40 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  41.18 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.93 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.66 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.66 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  38.59 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>