More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0157 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0157  putative methyltransferase  100 
 
 		 229 aa  473  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1546  generic methyltransferase  37.5 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2169  methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0512  hypothetical protein  36 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1468  methyltransferase type 11  40.31 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.197661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1686  methyltransferase  37.89 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2048  hypothetical protein  35.35 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.94686e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0447  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1285  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1596  Methyltransferase type 11  32.55 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  31.94 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0499  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.54 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0442  Methyltransferase type 11  39.59 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1688  methyltransferase  36.63 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.7 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.69 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.52 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.91 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.64 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  32.08 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.35 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.93 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  45.9 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.54 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  26.98 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.05 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.34 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.99 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  37.25 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.63 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.63 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.33 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.14 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.14 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.68 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.65 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.83 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  28.4 
 
 		 377 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  28.02 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.23 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.36 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 355 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.39 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0806  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.83 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.622934  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  37.8 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.23 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.23 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  37.14 
 
 		 658 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.23 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.38 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  26.73 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 282 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.23 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  31.63 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 265 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.39 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  31.96 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>