More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1562 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1562  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 568 aa  1144    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  53.58 
 
 		 572 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0385  AMP-dependent synthetase and ligase  53.12 
 
 		 572 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1308  AMP-dependent synthetase and ligase  50.94 
 
 		 633 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.748569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  43.15 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000292918  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  37.06 
 
 		 638 aa  332  1e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  36.17 
 
 		 666 aa  324  3e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  35.18 
 
 		 649 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  35.29 
 
 		 667 aa  309  6.999999999999999e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  35.11 
 
 		 668 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  34.16 
 
 		 666 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  33.91 
 
 		 638 aa  301  2e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  35.93 
 
 		 670 aa  300  5e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  33.51 
 
 		 656 aa  300  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  33.77 
 
 		 649 aa  296  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  33.12 
 
 		 692 aa  293  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  33.55 
 
 		 655 aa  292  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  31.86 
 
 		 667 aa  291  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  34.85 
 
 		 636 aa  290  4e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  33.95 
 
 		 666 aa  289  8e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  34.5 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  34.68 
 
 		 636 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  34.44 
 
 		 643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  34.18 
 
 		 648 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 664 aa  287  4e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 661 aa  287  4e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  33 
 
 		 670 aa  286  5e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  34.54 
 
 		 656 aa  286  5.999999999999999e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  34.43 
 
 		 661 aa  286  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  32.87 
 
 		 629 aa  286  9e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  33.68 
 
 		 661 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  31.93 
 
 		 666 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  32.67 
 
 		 629 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  34.9 
 
 		 674 aa  283  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  31.83 
 
 		 650 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  34.03 
 
 		 659 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  34.36 
 
 		 654 aa  282  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  31.38 
 
 		 667 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  31.53 
 
 		 657 aa  281  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  31.41 
 
 		 663 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  32.11 
 
 		 650 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  34.45 
 
 		 660 aa  279  9e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  32.95 
 
 		 663 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  33.5 
 
 		 639 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  34.9 
 
 		 680 aa  277  5e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  31.11 
 
 		 664 aa  276  9e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  33.06 
 
 		 660 aa  276  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  32.6 
 
 		 632 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  36.08 
 
 		 660 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  31.33 
 
 		 652 aa  274  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  32.43 
 
 		 632 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  32.18 
 
 		 652 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  32.88 
 
 		 651 aa  274  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  34.26 
 
 		 655 aa  274  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  32.58 
 
 		 660 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  33.22 
 
 		 659 aa  274  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  33.12 
 
 		 664 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  34.33 
 
 		 655 aa  273  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  33.74 
 
 		 644 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  32.52 
 
 		 665 aa  273  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  32.52 
 
 		 651 aa  273  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  32.63 
 
 		 660 aa  273  7e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  33.45 
 
 		 654 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  33.45 
 
 		 658 aa  272  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  31.93 
 
 		 649 aa  272  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  33.39 
 
 		 661 aa  272  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  32.43 
 
 		 631 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  32.25 
 
 		 629 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  32.57 
 
 		 631 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  33.16 
 
 		 656 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  34.9 
 
 		 650 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  31.63 
 
 		 652 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  31.43 
 
 		 657 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  32.23 
 
 		 648 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  32.16 
 
 		 652 aa  269  8e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  34.12 
 
 		 667 aa  269  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  34.02 
 
 		 658 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  34.09 
 
 		 639 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  31.95 
 
 		 632 aa  269  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  33.93 
 
 		 651 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  32.51 
 
 		 635 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  33.22 
 
 		 661 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  33.11 
 
 		 715 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  33.33 
 
 		 649 aa  268  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  32.88 
 
 		 670 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  34.31 
 
 		 665 aa  267  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1748  acetate/CoA ligase  32.05 
 
 		 682 aa  267  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  31.5 
 
 		 667 aa  267  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  32.4 
 
 		 657 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  32.22 
 
 		 632 aa  266  8e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 652 aa  266  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0983  acetate/CoA ligase  34.13 
 
 		 665 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  31.54 
 
 		 656 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  32.92 
 
 		 661 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  32.41 
 
 		 631 aa  264  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  31.97 
 
 		 676 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  30.91 
 
 		 631 aa  264  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6251  acetate/CoA ligase  32.48 
 
 		 664 aa  264  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  33.01 
 
 		 660 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  31.9 
 
 		 661 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>