More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1163 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1163  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0342  hypothetical protein  73.33 
 
 		 195 aa  292  2e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1783  hypothetical protein  71.79 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.403074 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1312  hypothetical protein  72.45 
 
 		 194 aa  254  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0701  hypothetical protein  46.43 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000328167 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0078  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2058  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  35.5 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4818  abhydrolase  33.5 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.448323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0781  abhydrolase  32.34 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1401  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  26.67 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 390 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 344 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  35.79 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  35.21 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  38.03 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 354 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 322 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  35.29 
 
 		 258 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 296 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  37.07 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 290 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 288 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 		 332 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 		 332 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 		 332 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 397 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 		 335 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 339 aa  51.6  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 291 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 291 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 291 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.04 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.25 
 
 		 370 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.98 
 
 		 389 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 277 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.26 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  34.29 
 
 		 306 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 274 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45940  predicted protein  25.13 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  40.91 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 		 292 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 340 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 353 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 299 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 320 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0016  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 288 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 316 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 284 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  38.18 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 332 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 352 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 332 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  39.39 
 
 		 262 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 277 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 284 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.91 
 
 		 380 aa  48.9  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 352 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 299 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.01 
 
 		 374 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 299 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 299 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  30 
 
 		 324 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 299 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 299 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 299 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 284 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2263  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 287 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 276 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  33.05 
 
 		 273 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 255 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  31.78 
 
 		 377 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 279 aa  48.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 		 270 aa  47.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 406 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 343 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  31.48 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 279 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  33.01 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 387 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  34.65 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 324 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 296 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  34.65 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  35.21 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>