More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0675 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0675  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 		 333 aa  672    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1238  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  65.65 
 
 		 331 aa  457  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0185  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  65.96 
 
 		 335 aa  457  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.374978  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0202  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  72.16 
 
 		 291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.630911 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1605  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.24 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.119603  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1761  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.96 
 
 		 392 aa  202  8e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1607  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.34 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.553132 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1333  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.82 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.206464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1593  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.81 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.516871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  30.77 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  28.9 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  28.9 
 
 		 294 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  31.36 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  26.16 
 
 		 290 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0567  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.92 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000159646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  30.46 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  30.56 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  30.31 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  27.76 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  29.92 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  28.27 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  31.97 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.61 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  30 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  33.46 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  26.5 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  28.37 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  29.72 
 
 		 773 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  25.62 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  29.55 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  29.5 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  28.87 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  29.5 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  29.5 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  29.5 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  29.5 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  29.5 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  29.5 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  27.84 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  29.92 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.76 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  30.04 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  29.5 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  28.92 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3188  cysteine synthase B  28.92 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.124444  normal  0.617635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  29.11 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  30.83 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  29.21 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  25.89 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  28.41 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  29.28 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  28.57 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  29.5 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1100  cysteine synthase B  28.17 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00123647  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1067  cysteine synthase B  28.17 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000450075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  27.31 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  27.4 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  27.92 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3011  cysteine synthase B  28.57 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.421236  normal  0.0437724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  27.31 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  27.31 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  28.46 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  28.46 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  28.74 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0463  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.76 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0763  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.76 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0168407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3192  cysteine synthase  29.76 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3453  cysteine synthase B  29.41 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  28.52 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  28.52 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  29.07 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  28.46 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3598  cysteine synthase B  29.26 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  27.78 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0509  cysteine synthase  31.03 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.445859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  27.76 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0998  cysteine synthase B  27.82 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  28.41 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  28.11 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  27.87 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  27.76 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  27.14 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  31.42 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  27.76 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.29 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  25.78 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  28.08 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  29.07 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1605  O-acetylserine (thiol)-lyase  25.17 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  29.41 
 
 		 771 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  27.65 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  27.69 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  28.36 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.38 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  27.74 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  28.41 
 
 		 764 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1006  cysteine synthase B  28.63 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000380642  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0670  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  27.61 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  28.3 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  28.93 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>