More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0533 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0533  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 		 276 aa  548  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0641  Sec-independent protein translocase TatC  81.48 
 
 		 282 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1616  Sec-independent protein translocase TatC  78.07 
 
 		 282 aa  447  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0665  Sec-independent periplasmic protein translocase  76.3 
 
 		 281 aa  396  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.62 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3632  Sec-independent protein translocase TatC  27.55 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.03 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.15 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  30.15 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.15 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  29.77 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  29.32 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.77 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  29.77 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1464  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.47 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.879839  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1645  Sec-independent periplasmic protein translocase  31.56 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.876416  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.32 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.42 
 
 		 249 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.32 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  30.8 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.8 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0850  Sec-independent periplasmic protein translocase  30.28 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0556055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  30.8 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 		 250 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  27.94 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.01 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.85 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  33.73 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3820  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.46 
 
 		 297 aa  95.5  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00172839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.42 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.7 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0964  Sec-independent periplasmic protein translocase  29.15 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  28.68 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  30.63 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.89 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.28 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.99 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.28 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.79 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.28 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.28 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.28 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.69 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  29.3 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.69 
 
 		 268 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.84 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  30.3 
 
 		 250 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  27.21 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.5 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0725  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.52 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000256296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.21 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  27.31 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.41 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.39 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  26.89 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.18 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.54 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.8 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.06 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  27.99 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.66 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.96 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1801  Sec-independent protein translocase TatC  28.62 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2752  Sec-independent protein translocase TatC  28.62 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2701  Sec-independent protein translocase TatC  28.62 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  28.62 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3252  Sec-independent protein translocase TatC  28.62 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3711  Sec-independent protein translocase TatC  28.62 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3653  Sec-independent protein translocase TatC  28.62 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3888  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.89 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4969  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.37 
 
 		 285 aa  89  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000729191  hitchhiker  0.000000000000138567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2980  Sec-independent protein translocase TatC  29.07 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.27 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.07 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.27 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.07 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.07 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  27.57 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1460  Sec-independent protein translocase TatC  25 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.403826  normal  0.0434954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.07 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  27.64 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  27.64 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.27 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.65 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  27.24 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  28.19 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1220  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.95 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.65 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  27.24 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0795  Sec-independent protein translocase TatC  29.41 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.166427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  28.14 
 
 		 368 aa  85.5  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>