237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0236 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  75 
 
 		 202 aa  277  1e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  70.3 
 
 		 204 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  73.74 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  42.86 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  40.29 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  39.8 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  39.42 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  39.38 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  36.13 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  31.71 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  35.18 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  32.43 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  30.7 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  35.82 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  30.52 
 
 		 213 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  33.17 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  30.23 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  35.48 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  27.63 
 
 		 230 aa  104  8e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  33.82 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  33.8 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  32 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  36.32 
 
 		 273 aa  89.4  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  33.33 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  31.22 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  36.14 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1650  23S rRNA methyluridine methyltransferase  36.89 
 
 		 375 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  37.25 
 
 		 494 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  29.01 
 
 		 262 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  29.91 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  38.46 
 
 		 285 aa  51.2  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 288 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  41.1 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  41.33 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  40.96 
 
 		 407 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.254122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.84 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 385 aa  49.3  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  36.62 
 
 		 264 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  36.62 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.96 
 
 		 299 aa  48.5  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  30.67 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  41.56 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1963  23S rRNA methyluridine methyltransferase  32.14 
 
 		 375 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.333439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.07 
 
 		 296 aa  48.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.29 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  32 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  39.73 
 
 		 307 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  37.78 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  35.14 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  40.74 
 
 		 498 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  26.73 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.82 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  39.08 
 
 		 360 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  41.89 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  36.05 
 
 		 481 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  39.51 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  44.59 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  37.88 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  38.24 
 
 		 494 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.26 
 
 		 401 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1568  23S rRNA methyluridine methyltransferase  31.25 
 
 		 376 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  27.69 
 
 		 440 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  30.86 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 506 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3496  23S rRNA methyluridine methyltransferase  29.87 
 
 		 390 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  44.78 
 
 		 279 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1697  23S rRNA methyluridine methyltransferase  32.14 
 
 		 376 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  44 
 
 		 305 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  38.66 
 
 		 250 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2725  23S rRNA methyluridine methyltransferase  31.25 
 
 		 376 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  39.02 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  39.02 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2640  23S rRNA methyluridine methyltransferase  31.25 
 
 		 376 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000831969  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.75 
 
 		 297 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  45.33 
 
 		 295 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0968  hypothetical protein  27.64 
 
 		 540 aa  45.4  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0579  23S rRNA methyluridine methyltransferase  30.43 
 
 		 377 aa  45.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.89 
 
 		 309 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  28.57 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2390  23S rRNA methyluridine methyltransferase  34.87 
 
 		 382 aa  45.1  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.437044 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  28 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  35.71 
 
 		 449 aa  45.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  33.02 
 
 		 275 aa  45.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  33.94 
 
 		 395 aa  45.1  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2381  23S rRNA methyluridine methyltransferase  36.07 
 
 		 376 aa  44.7  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  44.64 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3424  23S rRNA methyluridine methyltransferase  29.22 
 
 		 390 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3619  23S rRNA methyluridine methyltransferase  29.22 
 
 		 390 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  43.28 
 
 		 257 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0868  23S rRNA methyluridine methyltransferase  29.22 
 
 		 390 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>