116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1099 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1099  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161791 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1610  glutamine amidotransferase-like protein  51.83 
 
 
223 aa  245  4e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0143  glutamine amidotransferase-like protein  54.13 
 
 
220 aa  227  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0457  glutamine amidotransferase-like protein  55.3 
 
 
220 aa  226  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000211825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  23.72 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1186  hypothetical protein  32.04 
 
 
219 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0171  glutamine amidotransferase-like protein  28.79 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  25.09 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  26.34 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  25.4 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0994  hypothetical protein  26.61 
 
 
219 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.811741  normal  0.0118978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  27.86 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  27.86 
 
 
264 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1482  hypothetical protein  32.35 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.168622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  25.1 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0855  glutamine amidotransferase, class-II  37.11 
 
 
248 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  23.74 
 
 
287 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  23.74 
 
 
287 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  25.87 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  24.07 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  24.72 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  28.83 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  26.95 
 
 
264 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  25 
 
 
275 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  22.92 
 
 
270 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  25.93 
 
 
263 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  26.82 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  25.27 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1317  hypothetical protein  21.86 
 
 
229 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0414  hypothetical protein  26.29 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  22.43 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  30.14 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0846  hypothetical protein  28.36 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.557231 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  25.75 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  25.75 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  21.13 
 
 
359 aa  49.3  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  23.51 
 
 
279 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  23.51 
 
 
279 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1080  glutamine amidotransferase-like protein  24.88 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  25.59 
 
 
261 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  24.6 
 
 
257 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  24.29 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  23.94 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2921  glutamine amidotransferase, class-II  25.29 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0460423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0234  glutamine amidotransferase, class-II  24.6 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0244  glutamine amidotransferase, class-II  24.6 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0224  glutamine amidotransferase, class-II  24.6 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03126  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
609 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  23.49 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  23.49 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  23.49 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  23.49 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  23.49 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  23.49 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  23.49 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1856  hypothetical protein  30.58 
 
 
220 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0526188  normal  0.336481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  24.01 
 
 
297 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  24.42 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  24.23 
 
 
287 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  24.01 
 
 
297 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  24.15 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  24.9 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  24.4 
 
 
279 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5484  hypothetical protein  22.13 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  23.13 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  27.71 
 
 
277 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  29.5 
 
 
259 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  24.55 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  28.26 
 
 
259 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  28.26 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  24.15 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  28.21 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2527  glutamine amidotransferase class-II  24.32 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.228426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2258  hypothetical protein  25.76 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14994  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase  30.61 
 
 
606 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.703916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  25.27 
 
 
340 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.44 
 
 
610 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  28.26 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  30 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  28.26 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  30.17 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  27.68 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  24.08 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  28.26 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  27.11 
 
 
277 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  30.36 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  30.36 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  30.36 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  30.36 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  26.3 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  26.15 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  26.9 
 
 
277 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  26.9 
 
 
288 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  29.41 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  27.11 
 
 
306 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  28.29 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0203  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.93 
 
 
606 aa  42.7  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  27.68 
 
 
270 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  27.89 
 
 
261 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.63 
 
 
612 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>