More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1085 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  100 
 
 		 397 aa  800    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  74.37 
 
 		 398 aa  612  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  74.62 
 
 		 398 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  44.03 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  37.68 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  37.72 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  39.12 
 
 		 407 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  38.87 
 
 		 403 aa  253  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  36.5 
 
 		 406 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  35.73 
 
 		 416 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  34.62 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  35.35 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  33.73 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  37.35 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  37.15 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  34.5 
 
 		 396 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  37.89 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  34.11 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  33.42 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  36.79 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  33.58 
 
 		 407 aa  223  7e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  37.43 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  38.17 
 
 		 393 aa  215  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  36.14 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  37.28 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  35.52 
 
 		 387 aa  213  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  37.22 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  34.22 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  37.31 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  33.62 
 
 		 369 aa  199  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  36.22 
 
 		 368 aa  196  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  33.43 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  30.43 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  30.61 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  29.68 
 
 		 474 aa  143  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  29.05 
 
 		 464 aa  143  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  29.05 
 
 		 464 aa  142  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  30.23 
 
 		 469 aa  142  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.12 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  29.1 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  30.16 
 
 		 468 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  28.47 
 
 		 470 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  30.32 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  28.12 
 
 		 465 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1078  FeS assembly protein SufB  28.48 
 
 		 471 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000122877  normal  0.697067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  29.07 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 		 488 aa  129  9.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  27.49 
 
 		 465 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  27.49 
 
 		 465 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  25 
 
 		 472 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  28.21 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  30.27 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  29.49 
 
 		 470 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  27.59 
 
 		 470 aa  127  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  26.69 
 
 		 466 aa  126  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  29.93 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  29.9 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  28.37 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  28.07 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  27.34 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.47 
 
 		 472 aa  123  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  27.68 
 
 		 465 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  27.68 
 
 		 465 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  27.1 
 
 		 470 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  27.68 
 
 		 465 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  27.68 
 
 		 463 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  29.9 
 
 		 552 aa  123  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  27.34 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  27.68 
 
 		 465 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  27.68 
 
 		 465 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  27.68 
 
 		 465 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  27.68 
 
 		 465 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  27.68 
 
 		 465 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.85 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.61 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  28.47 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  28.14 
 
 		 476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.14 
 
 		 482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0761  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.561648  normal  0.362829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.61 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  28.14 
 
 		 476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1745  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 		 474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  29.02 
 
 		 465 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  28.35 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  26.8 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  27.78 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  28.62 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  27.83 
 
 		 470 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  27.27 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  28.34 
 
 		 479 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.69 
 
 		 483 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1468  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.08 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454398  normal  0.0337836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.69 
 
 		 506 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  27.33 
 
 		 476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  26.18 
 
 		 470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  26.3 
 
 		 480 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  27.21 
 
 		 469 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  27.18 
 
 		 485 aa  116  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  28.04 
 
 		 470 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0084  FeS assembly protein SufB  26.15 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.597876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>