More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04579 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04579  exodeoxyribonuclease IX  100 
 
 		 328 aa  665    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0697  5'-3' exonuclease  76.75 
 
 		 316 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2973  5'-3' exonuclease  43.57 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  36.03 
 
 		 928 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  35.46 
 
 		 930 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.81 
 
 		 892 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  38.52 
 
 		 891 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 888 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  40.16 
 
 		 893 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  35.81 
 
 		 938 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.72 
 
 		 934 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 930 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 928 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  36.69 
 
 		 1010 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  35.79 
 
 		 928 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  35.99 
 
 		 892 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 1014 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  36.56 
 
 		 896 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  37.33 
 
 		 1021 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 926 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1158  exodeoxyribonuclease IX  36.65 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0177587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  34.67 
 
 		 935 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  36.56 
 
 		 896 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  36.64 
 
 		 1032 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  32.16 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  34.49 
 
 		 891 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  34.91 
 
 		 940 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  35 
 
 		 931 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  35.42 
 
 		 897 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  36.3 
 
 		 1033 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.58 
 
 		 928 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.2 
 
 		 903 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  35.07 
 
 		 899 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  35.07 
 
 		 897 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  36.22 
 
 		 930 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 929 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 928 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 928 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  35.42 
 
 		 979 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  31.72 
 
 		 850 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 928 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 928 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 928 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 928 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  36.43 
 
 		 928 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 928 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 929 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  34.72 
 
 		 897 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  34.2 
 
 		 1025 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  32.18 
 
 		 892 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  35.76 
 
 		 902 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 928 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2376  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  40.87 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  35.19 
 
 		 973 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 930 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  35.14 
 
 		 934 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.23 
 
 		 939 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  37.25 
 
 		 924 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2057  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  36.4 
 
 		 324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  36.97 
 
 		 906 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  35.11 
 
 		 480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  34.6 
 
 		 892 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  35 
 
 		 932 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  34.6 
 
 		 892 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  35 
 
 		 932 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  34 
 
 		 929 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 928 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  33.91 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 928 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  35 
 
 		 932 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  34.89 
 
 		 916 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  36.64 
 
 		 1020 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 928 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 928 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 928 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  35.48 
 
 		 911 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 878 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 935 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  33.01 
 
 		 979 aa  162  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  33.01 
 
 		 978 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 976 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 937 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 937 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  30.92 
 
 		 877 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  34.23 
 
 		 920 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  35.52 
 
 		 924 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  34.23 
 
 		 920 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 929 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  34.71 
 
 		 968 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  33.43 
 
 		 1060 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 928 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  35.56 
 
 		 926 aa  160  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  31.82 
 
 		 877 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  36.01 
 
 		 903 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  31.51 
 
 		 932 aa  159  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  33 
 
 		 937 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  33 
 
 		 888 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 1004 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 908 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  33.78 
 
 		 909 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>