More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02608 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02608  threonine dehydratase  100 
 
 		 356 aa  709    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3331  threonine dehydratase  89.07 
 
 		 363 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1204  threonine dehydratase  87.09 
 
 		 350 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1110  threonine dehydratase  86.75 
 
 		 350 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  46.98 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  42.68 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  38.65 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  38.64 
 
 		 402 aa  222  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  38.96 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  36.74 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  47.62 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  40.76 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  47.15 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  43.81 
 
 		 403 aa  204  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  43.28 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  40.33 
 
 		 395 aa  202  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  43.67 
 
 		 403 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  39.17 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  45.37 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  40.32 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  39.56 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  42.34 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  37.31 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02984  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0586  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.97 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3240  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  44.48 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3413  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0581  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02935  hypothetical protein  40.97 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4430  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.119659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3591  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3305  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0825845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  41.94 
 
 		 416 aa  189  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3506  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  42.67 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3602  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3539  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00163646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3435  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  39.62 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  38.66 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  40.66 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  38.87 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  41.01 
 
 		 503 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  33.69 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  39.49 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3432  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  43.85 
 
 		 402 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  40.51 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  35.08 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  41.37 
 
 		 418 aa  185  8e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  41.18 
 
 		 401 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  34.67 
 
 		 403 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  41.18 
 
 		 401 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  34.37 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.76 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  36.64 
 
 		 400 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  34.06 
 
 		 403 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  42.63 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3564  threonine dehydratase  40.32 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  39.42 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  43.17 
 
 		 415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  39.42 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  35.17 
 
 		 408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  43.23 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  33.74 
 
 		 403 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  41.01 
 
 		 527 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  39.06 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  36.86 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  37.84 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  42.41 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  43.14 
 
 		 403 aa  176  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  39.36 
 
 		 549 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  42.26 
 
 		 402 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  41.16 
 
 		 402 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  41.97 
 
 		 520 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  40.21 
 
 		 526 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  41.61 
 
 		 501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  35.2 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  39.68 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.78 
 
 		 320 aa  173  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  43.68 
 
 		 527 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.96 
 
 		 320 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  36.45 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 515 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  40.88 
 
 		 505 aa  172  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  40.79 
 
 		 415 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  38.44 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  42.5 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  41.99 
 
 		 507 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  38.44 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  38.96 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  40.51 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  39.17 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  37.46 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  39.17 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  34.41 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>