More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02361 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02361  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
312 aa  628  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3255  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  72.03 
 
 
312 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  38.64 
 
 
315 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1486  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.46 
 
 
311 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3900  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.26 
 
 
308 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0628  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.48 
 
 
320 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1896  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.42 
 
 
311 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00667656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4382  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.33 
 
 
321 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.01 
 
 
313 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  39.01 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0768  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.06 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.84 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.34 
 
 
311 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0061  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.66 
 
 
307 aa  169  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.86 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.48 
 
 
316 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0651  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40 
 
 
321 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  37.05 
 
 
309 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1178  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.87 
 
 
349 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.612504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.56 
 
 
338 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1195  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.87 
 
 
349 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  34.2 
 
 
311 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  34.53 
 
 
311 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4897  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.33 
 
 
346 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  34.2 
 
 
311 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1044  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  33.11 
 
 
321 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  34.2 
 
 
311 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1475  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.53 
 
 
311 aa  155  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0546979  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  40.35 
 
 
320 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1205  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.56 
 
 
349 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902231  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.44 
 
 
317 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2581  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  36.16 
 
 
309 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.11 
 
 
341 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1526  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.28 
 
 
349 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458985  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  33.75 
 
 
317 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  36.86 
 
 
310 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  33.88 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  33.88 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  33.99 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  33.88 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  33.88 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3506  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.69 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  36.1 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0542  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.29 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.488533  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  33.99 
 
 
311 aa  153  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  33.99 
 
 
311 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  33.99 
 
 
311 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2809  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.24 
 
 
319 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0181966  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3232  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.6 
 
 
318 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.594476  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.64 
 
 
318 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.99 
 
 
314 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  33.77 
 
 
335 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  36.45 
 
 
314 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  33.77 
 
 
313 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3373  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.11 
 
 
317 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  33.55 
 
 
311 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1819  ribonucleoside hydrolase RihC  32.44 
 
 
306 aa  149  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.76 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0672  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.33 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  34.29 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  36.69 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  33.77 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.85 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.14 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  35.81 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.56 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.81 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03204  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  38.36 
 
 
313 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.85 
 
 
350 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3809  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.94 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.13 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  34.97 
 
 
302 aa  146  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  32.9 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  32.9 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.76 
 
 
357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1356  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.65 
 
 
311 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1006  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.48 
 
 
312 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0522631  normal  0.0258769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.83 
 
 
312 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.53 
 
 
350 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  33.44 
 
 
313 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  35.71 
 
 
355 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  33.01 
 
 
310 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.45 
 
 
319 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.62 
 
 
317 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0759  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  40.33 
 
 
328 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.486217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  33.01 
 
 
312 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.79 
 
 
318 aa  143  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.33 
 
 
321 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.05 
 
 
314 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.19 
 
 
342 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.29 
 
 
322 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  34.71 
 
 
313 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  33.75 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  38.44 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.89 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.57 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  30.92 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  33.65 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  32.48 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  30.92 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>